1. Powołana przez Ministra Zdrowia i Opieki Społecznej w drodze aktu wewnętrznego Krajowa Rada Egzaminów Medycznych nie może ustalać żadnych reguł w sprawach przyjmowania na studia wyższe i rozstrzygać wątpliwości dotyczących regulaminu egzaminów wstępnych na studia wyższe.
2. Niedopuszczalne jest ustalanie regulaminu egzaminu wstępnego przez inny organ uczelni niż senat.
3. Wobec braku w treści uchwały rady wydziału lekarskiego i w treści aktu senatu akademii medycznej, zatwierdzającego tę uchwałę, szczegółowych regulacji dotyczących wycofywania oczywiście wadliwych pytań egzaminacyjnych, powstające wątpliwości powinny być wyjaśnione w ramach postępowania wyjaśniającego przewidzianego w kodeksie postępowania administracyjnego.
Naczelny Sąd Administracyjny uznał zasadność skargi Tomasza Z. na decyzję Rektora Akademii Medycznej w W. z dnia 13 września 1993 r. nr RD-521/93 w przedmiocie nieprzyjęcia na studia w roku akademickim 1993/94 i na podstawie art. 207 par. 2 pkt 1 i 3 Kpa uchylił zaskarżoną decyzję i decyzję Wydziałowej Komisji Rekrutacyjnej z dnia 8 lipca 1993 r. oraz zgodnie z art. 208 Kpa zasądził od Akademii Medycznej w W. na rzecz skarżącego Tomasza Z. kwotę 5.130.000 zł tytułem zwrotu kosztów postępowania.
Tomasz Z. ubiegał się w 1993 r. o przyjęcie na studia w Akademii Medycznej w W. na Wydziale Lekarskim i został dopuszczony do egzaminu wstępnego, przeprowadzonego w formie pisemnego testu. W wyniku oceny tego egzaminu uzyskał 105 punktów i decyzją Wydziałowej Komisji Rekrutacyjnej z 8 lipca 1993 r. nie został przyjęty na pierwszy rok studiów, gdyż minimalna liczba punktów kwalifikująca do przyjęcia wynosiła 106.
Na skutek odwołania Tomasza Z. Rektor Akademii Medycznej w W. decyzją z dnia 13 września 1993 r. nr RD-521/93, wydaną na podstawie ustawy z dnia 12 września 1990 r. o szkolnictwie wyższym /Dz.U. nr 65 poz. 385/ i par. 98 statutu Akademii Medycznej w W. z dnia 26 czerwca 1991 r., zgodnie z wnioskiem Uczelnianej Komisji Rekrutacyjnej utrzymał w mocy decyzję Wydziałowej Komisji Rekrutacyjnej.
Tomasz Z. złożył do Naczelnego Sądu Administracyjnego skargę na decyzję Rektora Akademii Medycznej w W., wnosząc o jej uchylenie.
W postępowaniu odwoławczym i w skardze do Naczelnego Sądu Administracyjnego skarżący podniósł następujące zarzuty:
1. Krajowa Rada Egzaminów Medycznych już po zakończeniu egzaminów wycofała dwa pytania z powodu błędów edytorskich i w związku z tym wszystkim zdającym dodano po dwa punkty. Na jedno z tych pytań, nr 50 wersji drugiej z biologii, skarżący udzielił prawidłowej odpowiedzi i w wyniku tego został pozbawiony jednego punktu w porównaniu z innymi kandydatami, którzy na pytanie to nie udzielili żadnej odpowiedzi.
2. Zadanie 13 wersji drugiej z biologii wykraczało poza treść programu nauczania w szkole średniej. Oprócz prawidłowej odpowiedzi pod literą "o" w zadaniu tym posłużono się oznaczeniami, które nie były znane uczniom szkół średnich, i to spowodowało trudności w udzieleniu prawidłowej odpowiedzi.
3. Pytanie nr 16 wersji drugiej z biologii dotknięte było błędem edytorskim, wobec czego pytanie to nie powinno być podstawą oceny zdającego.
Podobnie wadliwie sformułowane było zadanie nr 23 wersji drugiej z biologii, na które każda z przewidzianych w tekście odpowiedzi nie była właściwa.
4. Na pytanie nr 39 dwie odpowiedzi są poprawne, a mianowicie oznaczone literami "b" i "d". Skarżący wskazał odpowiedź oznaczoną literą "b" i odpowiedź ta powinna być oceniona pozytywnie, mimo że jako prawidłową przewidziano w założeniu odpowiedź pod literą "d".
W odpowiedzi na skargę Akademia Medyczna wniosła o jej oddalenie i wyjaśniła co następuje:
Ad 1/ Wycofanie pytania z fizyki /36 wersji I i 10 wersji II/ i biologii /59 wersji I i 50 wersji II/ spowodowane było błędami w ich treści. Stosownie do opinii Zespołu Organizacyjnego Krajowej Rady Egzaminów Medycznych z dnia 12 sierpnia 1993 r. wycofanie pytań nastąpiło zgodnie z regulaminem przyjętym przez Kolegium Rektorów w dniu 15 grudnia 1993 r. Skarżący został zaznajomiony z jego treścią, co potwierdził w swoim oświadczeniu z 1 lipca 1993 r.
Postanowienie ust. 9 tego regulaminu dopuszczało możliwość wycofania pytania i uznania go za niebyłe po przeprowadzeniu egzaminu, lecz przed jego ogłoszeniem, w wypadku wadliwego lub nieczytelnego druku, nie wykrytego błędu edytorskiego, powodującego niejednoznaczności pytania w opinii ekspertów KREM, oraz każdej innej wady technicznej lub przeoczenia Komisji Recenzentów, naruszających jednolitość lub obiektywność warunków i czasu egzaminu.