Na podstawie art. 12 ust. 1 ustawy z dnia 31 stycznia 1989 r. o gospodarce finansowej przedsiębiorstw państwowych /Dz.U. 1992 nr 6 poz. 27 ze zm./ w brzmieniu nadanym przez ustawę z dnia 1 grudnia 1995 r. o zmianie ustawy o gospodarce finansowej przedsiębiorstw państwowych oraz ustawy o przedsiębiorstwach państwowych /Dz.U. nr 154 poz. 791/ przedsiębiorstwa państwowe są obowiązane do dokonywania wpłat z zysku na rzecz budżetu państwa po opodatkowaniu podatkiem dochodowym obliczonym zgodnie z art. 19 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych /Dz.U. 1993 nr 106 poz. 482 ze zm./ z zastosowaniem art. 21 i art. 22 ustawy.
Naczelny Sąd Administracyjny uznał zasadność skargi (...) Zakładów Celulozowo-Papierniczych w O. na decyzję Izby Skarbowej w (...) z dnia 15 września 1997 r. w przedmiocie określenia zobowiązania z tytułu wpłat z zysku za 1996 r. oraz wysokości zaliczek z tego tytułu za okres od stycznia do maja 1997 r. i na podstawie art. 22 ust. 2 pkt 1 ustawy z dnia 11 maja 1995 r. o Naczelnym Sądzie Administracyjnym /Dz.U. nr 74 poz. 368 ze zm./ uchylił zaskarżoną decyzję, a także - zgodnie z art. 55 ust. 1 powyższej ustawy - zasądził od Izby Skarbowej na rzecz skarżących Zakładów siedem tysięcy pięćset dziewięćdziesiąt cztery złote siedemdziesiąt groszy tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.
(...) Zakłady Celulozowo-Papiernicze w O. w stosownym terminie złożyły zeznanie o wysokości osiągniętego dochodu /poniesionej straty/ w podatku dochodowym od osób prawnych za rok podatkowy 1996 /deklaracja CIT-8/. W zeznaniu tym podatnik wykazał dochód podlegający opodatkowaniu w wysokości 4.697.084 zł i od tej sumy obliczył podatek należny według stawki 40 proc. na 1.878.834 zł. W deklaracji podatnik wykazał odliczenie w wysokości 2.458.216 zł od podatku na zasadzie art. 23 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych /Dz.U. 1993 nr 106 poz. 482 ze zm./ i w tej sytuacji podatek należny za rok podatkowy określił liczbą 0.
Także w stosownym terminie Zakłady złożyły zeznanie w postaci deklaracji /WZP-1R/ o wysokości zysku /straty/ osiągniętego przez przedsiębiorstwo państwowe i o wpłatach z zysku za rok obrotowy 1996. W podstawach naliczenia wysokości wpłat z zysku wykazały zysk brutto w wysokości 8.203.843 zł oraz podatek dochodowy w wysokości 1.878.833 zł, a więc zysk po opodatkowaniu podatkiem dochodowym w wysokości 6.324.650 zł.
W 1997 r. Zakłady złożyły deklarację /CIT-2/ o wysokości dochodu /straty/ za okres od 1 stycznia do 31 maja 1997 r. W deklaracji podatnik wykazał dochód podlegający opodatkowaniu w wysokości 2.059.596 zł i od tej sumy obliczył podatek należny według stawki 38 proc. w wysokości 782.646 zł. W tejże deklaracji podatnik wykazał odliczenie w wysokości 782.646 zł od podatku na zasadzie art. 23 powyższej ustawy i w tej sytuacji podatek należny określił liczbą 0.
Przedsiębiorstwo złożyło także deklarację /WZP-1M/ o wysokości zysku /straty/ osiągniętego przez przedsiębiorstwo państwowe i o wpłatach z zysku za maj 1997 r. W podstawach naliczenia wysokości wpłat z zysku wykazało zysk brutto /narastająco od początku roku obrotowego/ na sumę 1.951.819 zł oraz podatek dochodowy /od początku roku obrotowego/ w wysokości 782.647 zł, a więc zysk po opodatkowaniu podatkiem dochodowym w wysokości 1.169.172 zł.
Pismem z dnia 3 czerwca 1997 r. Naczelnik Urzędu Skarbowego w O. powiadomił podatnika o wszczęciu z urzędu postępowania w sprawie prawidłowości rozliczenia z tytułu wpłat z zysku należnych za rok 1996 i należnych zaliczek w roku 1997. Urząd Skarbowy poinformował, że dysponując deklaracjami podatnika /CIT-8, CIT-2, WZP-1R, WZP-1M/, a także deklaracją CIT-6 o wysokości pobranego podatku dochodowego oraz raportem z badania sprawozdania finansowego Zakładów za rok 1996 z bilansem i rachunkiem zysków i strat, wyda stosowną decyzję podatkową.
Urząd Skarbowy, "po przeanalizowaniu sposobu rozliczenia wpłat z zysku (...)", decyzją z dnia 25 czerwca 1997 r. określił zobowiązanie z tytułu wpłat z zysku za rok 1996 w wysokości 1.230.522,50 zł oraz określił wysokość zaliczki z tytułu wpłat z zysku za okres od stycznia do maja 1997 r. na 292.772,90 zł. Za podstawę prawną decyzji przyjęto art. 104 Kpa, art. 12 ustawy z dnia 31 stycznia 1989 r. o gospodarce finansowej przedsiębiorstw państwowych /Dz.U. 1992 nr 6 poz. 27 ze zm./ oraz rozporządzenie Ministra Finansów z dnia 21 lutego 1996 r. w sprawie określenia terminów i trybu wpłat z zysku oraz wzorów i terminów składania deklaracji przez przedsiębiorstwa państwowe /Dz.U. nr 21 poz. 99/. Urząd Skarbowy twierdził, że w przypadku Zakładów nie ma podstawy do zmniejszenia zysku brutto o podatek dochodowy w latach 1996 i 1997, ponieważ należny podatek dochodowy do zapłaty nie wystąpił. Organ I instancji nie zakwestionował faktu, iż przedsiębiorstwo otrzymuje należne dochody z tytułu udziału w zyskach innych osób prawnych i że Zakłady uiściły za pośrednictwem płatnika podatek zryczałtowany od otrzymanych dywidend. Urząd Skarbowy nie zanegował także faktu, iż przedsiębiorstwo odliczyło - na podstawie art. 23 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych - kwotę podatku zryczałtowanego od otrzymanej dywidendy. Podatek zryczałtowany jednak przekracza kwotę podatku obliczonego zgodnie z art. 19 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych i będzie mógł być odliczony w następnych latach podatkowych. Organ podatkowy zatem przyjął, że podatek dochodowy wyniósł 0 w roku 1996 i w miesiącach od stycznia do maja 1997 r., a zatem zysk brutto nie mógł być pomniejszony o kwoty wskazane przez podatnika. W efekcie Zakłady powinny dopłacić 281.824,50 zł za rok 1996 tytułem wpłaty z zysku oraz wpłacić 97.910,90 zł tytułem należnej zaliczki na wpłaty z zysku za okres od stycznia do maja 1997 r.