Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący Sędzia NSA Rafał Batorowicz (spr.) Sędziowie Jan Bała NSA Kazimierz Brzeziński Protokolant Beata Kołosowska po rozpoznaniu w dniu 21 października 2008 r. na rozprawie w Izbie Gospodarczej skargi kasacyjnej Ministra Finansów od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w W. z dnia 3 grudnia 2007 r. sygn. akt III SA/Wa 1446/07 w sprawie ze skargi M. Spółki z o.o. w Ż. na decyzję Ministra Finansów z dnia [...] czerwca 2007 r. nr [...] w przedmiocie ustalania ceny transakcyjnej 1. uchyla zaskarżony wyrok, 2. oddala skargę, 3. zasądza od M. Spółki z o.o. w Ż. na rzecz Ministra Finansów kwotę 730 (siedemset trzydzieści) złotych tytułem kosztów postępowania.
Wojewódzki Sąd Administracyjny w W. wyrokiem z dnia 3 grudnia 2007 r., sygn. akt III SA/Wa 1446/07, po rozpoznaniu sprawy ze skargi M. Spółki z o.o. z siedzibą w Ż. uchylił zaskarżoną decyzję Ministra Finansów z dnia [...] czerwca 2007 r., nr [...] oraz poprzedzającą ją decyzję Ministra Finansów z dnia [...] marca 2007 r., nr [...] w przedmiocie umorzenia postępowania w przedmiocie ustalania ceny transakcyjnej. Nadto Sąd stwierdził, że uchylone decyzje nie mogą być wykonane w całości oraz zasądził na rzecz skarżącej kwotę 740 zł tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.
Za podstawę rozstrzygnięcia Sąd I instancji przyjął następujący stan faktyczny i prawny:
W dniu [...] stycznia 2005 r. M. Spółka z o.o. z siedzibą w Ż. zawarła z M. S. A. z siedzibą w U. umowę przedwstępną w sprawie sprzedaży wartości niematerialnych i prawnych, zwanymi dalej "WNiP".
W dniu 20 grudnia 2006 r. skarżąca spółka złożyła do Ministra Finansów wniosek o uznanie, w drodze jednostronnego porozumienia co do cen transakcyjnych, prawidłowości wyboru i stosowania metody ustalania ceny transakcyjnej dla transakcji zakupu. Zgodnie z zawartą w dniu [...] stycznia 2005 r. umową przedwstępną, strony transakcji miały zawrzeć umowę przyrzeczoną do końca grudnia 2006 r. Strona przedstawiła kopię umowy sprzedaży z dnia 29 grudnia 2006 r. Z jej treści Minister Finansów wywiódł, iż transakcja sprzedaży WNiP miała charakter jednorazowy i została zakończona w dniu 29 grudnia 2006 r. W konsekwencji od tego dnia wniosek spółki z dnia 20 grudnia 2006 r. dotyczył transakcji jednorazowej i już dokonanej.
Z tych względów, Minister Finansów decyzją z dnia [...] marca 2007 r., na podstawie art. 20c oraz art. 212 i art. 208 § 1 w związku z art. 20q ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2005 r. Nr 8, poz. 60 ze zm.), uznając, iż zaistniały wymagane przesłanki ustawowe - umorzył postępowanie wszczęte wnioskiem M. Spółki z o.o. z dnia 20 grudnia 2006 r., jako bezprzedmiotowe.
Zaskarżoną do Sądu decyzją Minister Finansów nie uwzględnił odwołania strony od decyzji z dnia [...] marca 2007 r.
W uzasadnieniu decyzji organ wywiódł, że w sytuacji, gdy transakcja będąca przedmiotem postępowania jest zakończona, nie jest możliwe zakończenie postępowania poprzez wydanie decyzji w sprawie porozumienia, ponieważ, zgodnie z treścią art. 20i § 2 Ordynacji podatkowej, decyzja ta jest doręczana podmiotom powiązanym, z którymi mają być dokonywane transakcje. W związku z powyższym, zawarcie przez M. Spółkę z o.o. i M. S.A. w dniu [...] stycznia 2005 r. umowy przedwstępnej sprzedaży WNiP, nie uprawniało Ministra Finansów do wydania decyzji w sprawie porozumienia na podstawie art. 20i Ordynacji podatkowej ze względu na fakt, że transakcja została zakończona, czyli zrealizowana w dniu 29 grudnia 2006 r., to znaczy przed dniem doręczenia decyzji w sprawie porozumienia.
Minister Finansów wskazał także, iż błędnie zastosował w uzasadnieniu wydanej decyzji z dnia [...] marca 2007 r. brzmienie art. 20c Ordynacji podatkowej obowiązujące w 2006 r., gdyż powinien był zastosować ten przepis w brzmieniu obowiązującym w momencie wydania decyzji. W 2006 r. brzmienie przepisu rozpoczynało się od słów "Porozumienie może dotyczyć (...)", zaś w 2007 r. rozpoczyna się od słów "Porozumienie obejmuje (...)". Jednocześnie organ podkreślił, iż naruszenie to nie miało wpływu na rozstrzygnięcie sprawy.