Przepisy art. 20 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 11 poz. 50 ze zm./, w tym i ust. 2 tego artykule, nie mają zastosowania do podatników, którzy dokonują jednocześnie sprzedaży opodatkowanej oraz wykonują czynności nie objęte zakresem przedmiotowym podatku od towarów i usług.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu sprawy ze skargi Przedsiębiorstwa Produkcyjno-Usługowo-Handlowego "T." Spółka z o.o. w G. na decyzję Izby Skarbowej w O. z dnia 29 kwietnia 1997 r. (...) w przedmiocie podatku od towarów i usług za miesiące listopad i grudzień 1994 r. - uchyla zaskarżoną decyzję i decyzję Urzędu Skarbowego w G. z dnia 14 stycznia 1997 r. (...); (...).
W trakcie kontroli przeprowadzonej w Spółce w dniach 26 lipca - 10 września 1996 r. przez Urząd Kontroli Skarbowej w O. stwierdzono, m.in. iż Spółka dokonała obniżenia podatku należnego o podatek naliczony przy zakupie od Przedsiębiorstwa Handlowo-Produkcyjnego "Przymierze" Sp. z o.o. w W. /na podstawie umowy agencyjnej z dnia 15 listopada 1994 r./ usług polegających na stałym pośredniczeniu przy zawieraniu umów: pożyczki przeznaczonej na sfinansowanie zakupu obligacji nie będących obligacjami Skarbu Państwa, kupna-sprzedaży obligacji nie będących obligacjami Skarbu Państwa, kupna-sprzedaży obligacji Skarbu Państwa. Powyższe usługi zostały udokumentowane dwiema fakturami: (...) z dnia 18 listopada 1994 r. o wartości 121.512.000 zł /przed denominacją/, w tym podatek od towarów i usług 21.912.000 zł i (...) z dnia 14 grudnia 1994 r., opiewającą na identyczne kwoty. Obniżenie podatku należnego o podatek naliczony wynikający z tych faktur kontrolujący zakwestionowali i uznali za sprzeczne z art. 25 ust. 1 pkt 3 ustawy o podatku od towarów i usług i ustalili "sankcję" z art. 27 ust. 5 pkt 2. ustawy.
W związku z żądaniem skierowania sprawy na drogę postępowania w sprawach zobowiązań podatkowych Urząd Skarbowy w G. decyzją z dnia 14 stycznia 1997 r. (...) określił wysokość zobowiązania w podatku od towarów i usług za przedmiotowe miesiące w kwocie odpowiadającej zawyżeniu podatku naliczonego oraz ustalił dodatkowe zobowiązanie podatkowe w wysokości 30 procent zawyżenia zwrotu różnicy podatku.
Po rozpatrzeniu odwołania od tej decyzji Izba Skarbowa w O. decyzją z dnia 29 kwietnia 1997 r. (...) decyzję organu I instancji uchyliła w części dotyczącej określenia wysokości zobowiązań za listopad i grudzień 1994 r. i określiła wysokość nadwyżek podatku naliczonego nad należnym /za miesiąc listopad w części do zwrotu/ uznając, iż mimo powołania prawidłowej podstawy prawnej, tj. art. 27 ust. 6 ustawy organ I instancji błędnie ujął w pkt 1 sentencji swej decyzji sformułowanie "zobowiązanie w podatku od towarów i usług" w sytuacji, gdy pomimo zmniejszenia wysokości podatku naliczonego obniżającego podatek należny o kwotę wynikającą z faktur dokumentujących przedmiotowe usługi agencyjne, w dalszym ciągu u podatnika za listopad i grudzień 1994 r. pozostają nadwyżki podatku naliczonego nad należnym, a więc sytuacja pod względem prawnym jest odmienna, niż przy zaistnieniu zobowiązania podatkowego, w rozumieniu art. 2 ust. 1 ustawy z dnia 19 grudnia 1980 r. o zobowiązaniach podatkowych /Dz.U. 1993 nr 108 poz. 486 ze zm./.