Dnia 17 października 2008 roku Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Zbigniew Łoboda (sprawozdawca), Sędziowie Sędzia WSA Ireneusz Dukiel, Asesor WSA Katarzyna Borońska, Protokolant Katarzyna Wilczek, po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 3 października 2008 r. sprawy ze skargi A S.A. we W. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej we W. z dnia [...] Nr [...] w przedmiocie zmiany postanowienia w sprawie interpretacji co do zakresu i sposobu zastosowania prawa podatkowego oddala skargę.
Przedmiotem skargi wniesionej przez A S.A. we W. do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego we Wrocławiu była decyzja Dyrektora Izby Skarbowej we W. z dnia [...] (nr [...]), którą organ utrzymał w mocy swoją decyzję z dnia [...] (nr [...]), zmieniającą z urzędu postanowienie w przedmiocie interpretacji co do zakresu i sposobu zastosowania prawa podatkowego, wydane przez Naczelnika D. Urzędu Skarbowego we W. w dniu [...] (nr [...]).
Pismem z dnia [...] A S.A. we W. wystąpiła do Naczelnika D. Urzędu Skarbowego o udzielnie pisemnej interpretacji co do zakresu i sposobu zastosowania przepisów prawa podatkowego, a mianowicie: czy straty poniesione przez A w latach 2004-2005 w zakresie działalności zwolnionej z opodatkowania na podstawie otrzymanego zezwolenia strefowego, mogą pomniejszać dochód strefowy, zwolniony z opodatkowania, uzyskany w roku 2006 i latach kolejnych w wysokości określonej w art. 7 ust. 5 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych ?
W uzasadnieniu pisma spółka A przytoczyła, że prowadzi działalność gospodarczą na terenie W. Specjalnej Strefy Ekonomicznej B na podstawie zezwolenia Ministra Gospodarki, Pracy i Polityki Społecznej nr [...] z dnia [...]. W pierwszych dwóch latach działania na terenie strefy spółka osiągnęła stratę w zakresie działalności tam wykonywanej, a począwszy od 2006 r. odnotowuje zysk. Według strony na postawione pytanie należy udzielić odpowiedzi twierdzącej. Wskazano, że wobec tego, iż art. 7 ust. 3 i ust. 4. ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych (Dz. U. z 2000 r., Nr 54, poz. 654 ze zm.), zwanej również dalej "ustawą dochodową" bądź "pdop", nie odnosi się do problematyki rozliczenia straty z działalności zwolnionej od podatku - z dochodem z tej działalności, istotna się staje regulacja art. 17 ust. 4 - ust. 6 (w związku z ust. 1 pkt 34) ustawy dochodowej. Skoro bowiem wynika z niej, że stratę uzyskaną z tytułu działalności zwolnionej pomniejsza dochód z tej działalności (zwolnionej), to znaczy, że w ogóle ustawodawca dopuszcza ustalenie straty z działności strefowej. Za możliwością uwzględnienia straty dla potrzeb obliczenia limitu zwolnienia, przemawiają inne jeszcze względy. Jeżeli w oparciu o art. 87 TWE pomoc publiczna prowadzi do uprzywilejowania przedsiębiorcy, to tym bardziej nie można pogarszać sytuacji podmiotu strefowego, wobec tych podatników, którzy będąc poza zakresem zwolnienia, bez przeszkód rozliczają stratę. Nadto podstawą funkcjonującego w ramach przepisów wykonawczych do ustawy z dnia 30 kwietnia 2004 r. o postępowaniu w sprawach dotyczących pomocy publicznej (Dz. U. Nr 123, 1291 ze zm.), tzw. ekwiwalentu dotacji brutto, jest uchwycenie faktycznej korzyści ekonomicznej jaką uzyskał beneficjent pomocy, zaś rzeczywista korzyść jest nadwyżką ponad osiągniętą stratę.
Wskazanym powyżej postanowieniem z dnia [...] (nr [...]) Naczelnik D. Urzędu Skarbowego orzekł, że stanowisko spółki było prawidłowe, z czego wynika, że podatnik ma prawo do pomniejszenia dochodu uzyskanego z działności gospodarczej prowadzonej na terenie strefy w ramach zezwolenia, o równowartość strat poniesionych na tej działalności dla celów określenia wielkości pomocy publicznej z tytułu zwolnienia z podatku dochodowego. Dodał organ, że rozliczenia strat należy dokonać według zasady określonej w art. 7 ust. 5 pdop. Jakkolwiek działanie takie nie wpływa na wysokość należnego podatku z tytułu dochodu objętego zwolnieniem, to decyduje o stopniu wykorzystania przez spółkę limitu pomocy publicznej.