Wojewódzki Sąd Administracyjny we Wrocławiu w składzie następującym: Przewodniczący: Sędzia WSA Anetta Chołuj (sprawozdawca), Sędziowie: Sędzia WSA Zbigniew Łoboda, Sędzia WSA Jadwiga Danuta Mróz, Protokolant: referent Edyta Forysiak, po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 17 listopada 2016 r. sprawy ze skargi A sp. z o.o. z/s w L. na postanowienie Dyrektora Izby Skarbowej we W. z dnia [...] kwietnia 2016 r. nr [...] w przedmiocie zaliczenia zwrotu podatku od towarów i usług wraz z należnym oprocentowaniem na poczet zaliczek w podatku dochodowym od osób prawnych, zaliczek w podatku dochodowym od osób fizycznych i zobowiązań w podatku od towarów i usług oddala skargę w całości.
Przedmiotem skargi jest postanowienie Dyrektora Izby Skarbowej we W.z dnia [...] kwietnia 2016 r., nr [...], utrzymujące w mocy postanowienie Naczelnika Urzędu Skarbowego w L. z dnia [...] października 2015 r., nr [...], w sprawie zaliczenia zwrotu podatku od towarów i usług za styczeń 2013 r. w kwocie 27.943,00 zł wraz z należnym oprocentowaniem w kwocie 1.420,00 zł na rzecz A sp. z o.o. z/s w L. (dalej: strona, skarżąca, spółka, podatnik) na poczet zaliczek w podatku dochodowym od osób prawnych, zaliczek w podatku dochodowym od osób fizycznych z tytułu wypłaconych wynagrodzeń, zobowiązań w podatku od towarów i usług.
Jak wynika z akt sprawy, w dniu [...]lutego 2013 r. do Urzędu Skarbowego w L. wpłynęła deklaracja VAT-7 dla podatku od towarów i usług za styczeń 2013 r., z wykazaną kwotą do zwrotu na rachunek bankowy podatnika w terminie 25 dni w wysokości 561.203,00 zł. Ustawowy termin zwrotu upływał w dniu [...] lutego 2013 r. Postanowieniem z dnia [...] lutego 2013 r. Dyrektor Urzędu Kontroli Skarbowej we W. Ośrodek Zamiejscowy w L. wszczął postępowanie kontrolne w zakresie zasadności zwrotu podatku od towarów i usług za styczeń 2013 r. Następnie postanowieniem z dnia [...] lutego 2013 r. Naczelnik Urzędu Skarbowego w L. przedłużył termin zwrotu podatku od towarów i usług za styczeń 2013 r. do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia podatnika. Decyzją z dnia [...] sierpnia 2015 r., nr [...], Dyrektor Urzędu Kontroli Skarbowej we W. określił spółce za styczeń 2013 r. nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym kwotę do zwrotu w wysokości 27.943,00 zł. Decyzję doręczono podatnikowi w dniu [...] sierpnia 2015 r.
Postanowieniem z dnia [...] października 2015 r. Naczelnik Urzędu Skarbowego w L. zaliczył zwrot podatku od towarów i usług za styczeń 2013 r., według decyzji Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej we W. z dnia [...] sierpnia 2015 r., w kwocie 27.943,00 zł wraz z należnym oprocentowaniem w kwocie 1.420,00 zł na poczet: - zaliczek w podatku dochodowym od osób prawnych za: czerwiec 2013 r. w kwocie 697,00 zł, wrzesień 2013 r. w kwocie 133,00 zł, grudzień 2013 r. w kwocie 317.00 zł, styczeń 2014 r. w kwocie 7.698,00 zł, luty 2014 r. w kwocie 1 630.00 zł; - zaliczek w podatku dochodowym od osób fizycznych z tytułu wypłaconych wynagrodzeń za: sierpień 2013 r. w kwocie 103,00 zł, wrzesień 2013 r. w kwocie 103.00 zł, listopad 2013 r. w kwocie 103,00 zł, grudzień 2013 r. w kwocie 97.00 zł, styczeń 2014 r. w kwocie 103.00 zł. luty 2014 r. w kwocie 52,00 zł; - zobowiązań w podatku od towarów i usług za: styczeń 2014 r. w kwocie 17.620.00 zł i za luty 2014 r. w kwocie 707,00 zł. W postanowieniu wskazano, że oprocentowanie przedmiotowego zwrotu podatku od towarów i usług za styczeń 2013 r. w kwocie 27.943,00 zł naliczono zgodnie z art. 87 ust. 2 ustawy z dnia 11 marca 2004 r. o podatku od towarów i usług (tekst jedn. Dz. U. z 2011 r. Nr 177 poz. 1054 ze zm., dalej: u.p.t.u.) w wysokości odpowiadającej opłacie prolongacyjnej.