1. Przepis par. 54 ust. 4 pkt 5 lit. "c" rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 15 grudnia 1997 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 156 poz. 1024/ może mieć zastosowanie do przekazania towarów między zakładem osoby prawnej, będącym podatnikiem podatku od towarów i usług, oraz tą osobą prawną.
2. Sprzedażą w rozumieniu art. 5 ust. 3 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 jest przekazywanie towarów oraz świadczenie usług między osobą prawną a oddziałem tej osoby, posiadającym status podatnika podatku od towarów i usług.
G. Spółka z o.o. w W. zaskarżyła do Naczelnego Sądu Administracyjnego decyzją przekazania towarów Izby Skarbowej w W. z dnia 20 października 2000 r. utrzymującą w mocy decyzję Inspektora Kontroli Skarbowej z dnia 7 czerwca 2000 r. określającą w podatku od towarów i usług za listopad 1998 r. nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym do przeniesienia na miesiąc następny w kwocie 44.799 zł oraz ustalającą dodatkowe zobowiązanie podatkowe w wysokości 13.464 zł.
W wyniku przeprowadzonej kontroli w zakresie rozliczeń w podatku od towarów i usług za 1998 r. Inspektor Kontroli Skarbowej ustalił, iż Spółka dokonując rozliczenia za kontrolowany okres nieprawidłowo wykazała kwotę podatku naliczonego z uwagi na przyjęcie do rozliczenia podatku wynikającego z faktur dokumentujących zakupy dokonane w Oddziale Spółki posiadającym status zakładu pracy chronionej. Oddział Spółki powołany został 29 maja 1996 r. i zarejestrowany jako odrębny podatnik podatku od towarów i usług przez Urząd Skarbowy W. decyzją z dnia 12 lipca 1996 r. Od września 1998 r. Oddział Spółki, będący zakładem pracy chronionej, sprzedawał na rzecz Spółki wyroby, które następnie przez Spółkę były eksportowane. W toku kontroli ustalono, iż wcześniej Oddział samodzielnie eksportował wyroby, natomiast od 1 września 1998 r. zarządzeniem Prezesa Zarządu Spółki z dnia 15 września 1998 r. spółka przejęła organizację eksportu wyrobów z produkcji Oddziału.
Inspektor Kontroli Skarbowej wskazując na fakt korzystania z ulg podatkowych przez Oddział jako Zakładu Pracy Chronionej, stosowanie przez Spółkę stawki "0" procent z tytułu realizowania eksportu, oraz wykorzystywanie mechanizmów powstawania obowiązku podatkowego w podatku od towarów i usług stwierdził, iż do wykonywanych czynności między Spółką a Oddziałem mają zastosowanie przepisy par. 54 ust. 4 pkt 5 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 15 grudnia 1997 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 156 poz. 1024/. Wymienioną wyżej decyzją uwzględniając dokonane ustalenia rozliczenie Spółki w zakresie podatku naliczonego zostało pomniejszone o wielkość odpowiadającą wartości podatku naliczonego zawartego w fakturach otrzymanych od Oddziału sp. z o.o. G. w miesiącu rozliczeniowym.
Odwołując się od powyższej decyzji Spółka podniosła, iż wykonywane przez Spółkę i Oddział czynności zgodne były z przepisami w tym zakresie obowiązującymi, a przyjęta organizacja sprzedaży znajduje oparcie w piśmie Ministra Finansów z dnia 8 maja 1996 r. nr PP1-7201-79/96/ER, w którym wskazano na możliwość wyodrębniania w ramach zakładów pracy chronionej wyspecjalizowanych biur handlu zagranicznego. Nadto w Spółce zatrudniona była wykwalifikowana kadra, obsługująca skład celny, zatem bez dodatkowych nakładów można było przy wykorzystaniu istniejących struktur prowadzić działalność eksportową.