Wojewódzki Sąd Administracyjny w Kielcach w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Danuta Kuchta, Sędziowie Sędzia WSA Ewa Rojek,, Sędzia WSA Mirosław Surma (spr.), Protokolant Sekretarz sądowy Michał Gajda, po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 17 grudnia 2009r. sprawy ze skargi E. ,,S" Sp. z o.o. w J. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w K. z dnia [...]. nr [...] w przedmiocie podatku od czynności cywilnoprawnych oddala skargę.
Decyzją z dnia [...] nr [...] Dyrektor Izby Skarbowej utrzymał w mocy decyzję Naczelnika Urzędu Skarbowego z dnia [...] nr [...] odmawiającą Spółce A. w J. stwierdzenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie [...]zł.
W uzasadnieniu decyzji organ wyjaśnił, że w dniu 31 stycznia 2008r. aktem notarialnym Rep. A Nr [...] została zawarta umowa spółki z ograniczoną odpowiedzialnością pod firmą A. z siedzibą w J. Udziałowcami Spółki są M. F. G. i M. S. G. Zgodnie z artykułem 4 umowy kapitał zakładowy spółki wynosi 184.020.000 zł i dzieli się na 184.020 udziałów o wartości nominalnej 1.000 zł każdy. Główny udziałowiec M. G. objął 184.000 udziałów pokrywając je wniesionym do Spółki aportem w postaci przedsiębiorstwa B. . Od umowy spółki notariusz jako płatnik pobrał na podstawie art. 7 ust. 1 pkt 9 ustawy z dnia 9 września 2000r. o podatku od czynności cywilnoprawnych podatek w kwocie 920.100 zł, stanowiącej 0,5% podstawy opodatkowania, tj. kapitału zakładowego Spółki wynoszącego
184.020.000 zł. Aneksem podpisanym w dniu 8 lutego 2008r. nazwa Spółki została zmieniona na A. Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością, przy czym zmiany te nie wpłynęły na postawę opodatkowania podatkiem od czynności cywilnoprawnych. W dniu 2 czerwca 2009r. do Urzędu Skarbowego wpłynął wniosek A. Sp. z o.o., w którym wniesiono o zwrot nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie [...]zł zapłaconego od umowy spółki.
Organ wyjaśnił, że nie istnieją podstawy do uznania, że podatek zapłacony przez A. Sp. z o.o. w J. w kwocie [...] zł był nienależny. Obowiązek podatkowy zgodnie z art. 3 powołanej ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych powstał z chwilą dokonania czynności cywilnoprawnej, czyli w dacie zawarcia umowy spółki w dniu 31 stycznia 2008r. W brzmieniu obowiązującym w tym dniu podatek od czynności cywilnoprawnych był odpowiednikiem podatku kapitałowego uregulowanego w Dyrektywie Rady z dnia 17 lipca 1969r. dotyczącej podatków pośrednich od gromadzenia kapitału (69/335/EWG).
Organ wskazał, że przy interpretacji i stosowaniu Dyrektywy nr 69/335/EWG należy uwzględnić to, iż Polska stała się członkiem Wspólnot Europejskich począwszy od 1 maja 2004r. Zgodnie z treścią art. 2 Aktu dotyczącego warunków przystąpienia Republiki Czeskiej, Republiki Estońskiej, Republiki Cypryjskiej, Republiki Łotewskiej, Republiki Litewskiej, Republiki Węgierskiej, Republiki Malty, Rzeczypospolitej Polskiej, Republiki Słowenii i Republiki Słowackiej oraz dostosowań w Traktatach stanowiących podstawę Unii Europejskiej, data ta jest dniem implementacji Dyrektywy nr 69/335/EWG przez Polskę. Oznacza to, że przed powyższym dniem wskazana Dyrektywa nie znajdowała w Polsce zastosowania. Żadne postanowienie powołanego Aktu ani jakiegokolwiek innego aktu prawa wspólnotowego nie określa innego terminu na implementację przez Polskę Dyrektywy nr 69/335/EWG. W konsekwencji jedyną wersją Dyrektywy nr 69/335/EWG wiążącą Polskę jest jej wersja obowiązująca na dzień 1 maja 2004r. Jest to wersja po nowelizacjach, w tym nowelizacji wprowadzonej Dyrektywą Rady z dnia 10 czerwca 1985 r. zmieniającą dyrektywę 69/335/EWG dotyczącą podatków pośrednich od gromadzenia kapitału (85/303/EWG - Dz. U. UE. z 1985r. L. 156 poz. 23).