Za prawidłową Sąd uznał także ocenę organu odwoławczego dotyczącą badanej decyzji w kontekście art. 35 ust. 1 pkt 3 Prawa budowlanego, obligującego organ architektoniczny do sprawdzenia kompletności projektu budowlanego. Podzielając tę ocenę, Sąd dodatkowo zauważa, iż projekt zagospodarowania terenu został wykonany na mapie do celów projektowych, aktualnej w świetle dat na niej widniejących - 4 kwiecień 2012 r. Nadto, Sąd stwierdza, że z uwagi na charakter inwestycji i rozwiązań zawartych w projekcie, nie sposób podzielić stanowisko skarżących co do tego, iż inwestycja ta wymagała uzyskania pozwolenia wodnoprawnego. Przypadki, w których pozwolenie to jest konieczne, uregulowane zostały w art. 122 ustawy z dnia 18 lipca 2001 r. Prawo wodne (Dz. U. z 2012 r., poz. 145 ze zm.). Wskazane pozwolenie jest wymagane m. in. w przypadku wprowadzania do urządzeń kanalizacyjnych, będących własnością innych podmiotów, ścieków przemysłowych zawierających substancje szczególnie szkodliwe dla środowiska wodnego określone w przepisach wydanych na podstawie art. 45a ust. 1. Z projektu budowlanego nie wynika, aby funkcjonowanie inwestycji powodowało powyższą sytuację, skoro projekt budowlany przewiduje zastosowanie separatora do oczyszczania ścieków przed ich wprowadzeniem do kanalizacji.
W końcu, Sąd uznał, że nie sposób stwierdzić, aby badana decyzja była wadliwa w stopniu kwalifikowanym z tej przyczyny, iż zatwierdza projekt przewidujący przed przystąpieniem do inwestycji - usunięcie zbiornika gazu znajdującego się na działce inwestora. Zbiornik ten został zaznaczony w projekcie, bezspornie znajduje się na dz. o nr. ew. [...] a jak wynika z części opisowej projektu - stanowi własność właściciela stacji paliw (i działki sąsiedniej) i jest przeznaczony do przeniesienia. Powyższe w żaden sposób nie stanowi o naruszeniu prawa w postepowaniu dotyczącym pozwolenia na budowę.
Z tych przyczyn, nie znajdując podstaw do uznania zarzutów skargi za zasadne i podzielając w całości ocenę dokonaną w sprawie przez Głównego Inspektora Nadzoru Budowlanego, na podstawie art. 151 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz. U. z 2016 r., poz. 718), Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie orzekł, jak w sentencji.