Użyte w przepisie art. 11 ust. 4 pkt 2 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych /Dz.U. 1993 nr 106 poz. 482 ze zm./ - w brzmieniu obowiązującym do dnia 31 grudnia 1998 r.- określenie "związek gospodarczy", aczkolwiek nie zostało w ustawie zdefiniowane, lecz użyte w tym przepisie dla wykazania powiązań pomiędzy podmiotami - uczestnikami obrotu gospodarczego, którzy w sposób odbiegający od warunków normalnych kształtowali swoje warunki świadczeń w celu niewykazania lub wykazania dochodu niższego, winno było być rozumiane jako całokształt powiązań i zależności, które wystąpiły w obrocie gospodarczym, w tym i zależności, czy też powiązań związanych z dysponowaniem kapitałem albo prawami wynikającymi z jego posiadania.
Naczelny Sąd Administracyjny oddalił na podstawie art. 27 ust. 1 ustawy z dnia 11 maja 1995 r. o Naczelnym Sądzie Administracyjnym /Dz.U. nr 74 poz. 368 ze zm./ skargę spółki akcyjnej "B" na decyzję Izby Skarbowej w (...) z dnia 30 listopada 1999 r. w przedmiocie podatku dochodowego od osób prawnych.
Decyzją z dnia 30 listopada 1999 r. (...), na podstawie art. 233 par. 1 pkt 2a ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./, art. 7 ust. 1, ust. 2, ust. 4, art. 11 ust. 1, ust. 2 i ust. 4 pkt 1, ust. 5 i ust. 7, art. 15 ust. 1 i ust. 4, art. 16 ust. 1 pkt 38, art. 19 ust. 1 pkt 2 ustawy z dnia 15 lutego 1992 r. o podatku dochodowym od osób prawnych /Dz.U. nr 106 poz. 482 z 1993 r. ze zm./ oraz par. 2 ust. 1 i ust. 2 par. 4 ust. 1, ust. 2 i ust. 4 par. 15 ust. 1 i ust. 2 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 10 października 1997 r. w sprawie sposobu i trybu określenia dochodów podatników w drodze oszacowania cen w transakcjach dokonywanych przez tych podatników /Dz.U. nr 128 poz. 8331, Izba Skarbowa w Sz. po rozpatrzeniu odwołania Spółki Akcyjnej "B." w Sz. od decyzji Inspektora Kontroli Skarbowej z Urzędu Kontroli Skarbowej w Sz. z dnia 14 czerwca 1999 r. (...) określającej zobowiązanie z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych za 1998 r. w kwocie 5.654.685 zł i zaległość z tego tytułu w kwocie 62.942 zł, uchyliła w części zaskarżoną decyzję i określiła wysokość zobowiązania w podatku dochodowym w kwocie 5.646.586 zł i zaległość z tytułu tego podatku w kwocie 54.843, -zł.
W uzasadnieniu decyzji organ odwoławczy wskazał, że Inspektor Kontroli Skarbowej po przeanalizowaniu zeznania o wysokości dochodu Spółki za 1998 r. i przeprowadzonej kontroli stwierdził, że Spółka zaniżyła dochód do opodatkowania o kwotę 174.840 zł. Spółka zaniżyła dochód 1998 r. o kwotę 82.580,79 zł na skutek udzielenia akcjonariuszom Spółki nieoprocentowanych pożyczek, zawyżenia kosztów uzyskania przychodu o kwotę 77.326,35 zł obejmującą wydatki nie związane z przychodami podatnika /54.826,35 zł/, stanowiącymi wynagrodzenia z tytułu umów zlecenia i o dzieło osób będących członkami rady nadzorczej Spółki /13.500 zł/ oraz wynagrodzenia nie dotyczącego okresu podatkowego /9.000 zł/. Nadto, kontrolujący Spółkę Inspektor zakwestionował zasadność obniżenia dochodu przed opodatkowaniem o kwotę 14.933,41 zł stanowiącą równowartość 113 straty zadeklarowanej w zeznaniu za 1997 r., gdy Spółka uzyskała za ten okres dochód ustalony przez organy podatkowe. Dysponując wyjaśnieniami Spółki, Inspektor Kontroli Skarbowej decyzją z 14 czerwca 1999 r. określił Spółce zobowiązanie w podatku dochodowym od osób prawnych w tym zaległość z tego tytułu.
W odwołaniu od Izby Skarbowej, Spółka zarzuciła naruszenie prawa, przez niezasadne zastosowanie przepisu art. 11 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, skoro kwota pożyczki była przeznaczona na konkretny cel i zabezpieczona dywidendą. Pożyczka może być umową odpłatną jak i nieodpłatną zgodnie z przepisami prawa cywilnego co oznacza, że metodami administracyjnymi nie można wpływać na zasadę swobody zawierania umów. Spółka zarzuciła również niezasadność zakwestionowania wynagrodzenia za wykonanie przez akcjonariuszy na rzecz Spółki umów cywilnoprawnych, jako kosztu uzyskania przychodu, w sytuacji gdy wykazany został związek przyczynowo-skutkowy tego wydatku z dochodem Spółki.