Art. 64 par. 2 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./ przewiduje potrącenie bieżących zobowiązań podatkowych oraz zaległości z wzajemnej, bezspornej i wymagalnej wierzytelności wobec państwowych jednostek budżetowych z określonych tytułów.
Koniecznym warunkiem potrącenia jest to aby to była wierzytelność wobec państwowej jednostki budżetowej.
Izba Skarbowa w S. Ośrodek Zamiejscowy w K. decyzją z dnia 17 listopada 1999 r., wydaną w postępowaniu odwoławczym, utrzymała w mocy decyzję Urzędu Skarbowego w K. z 31 sierpnia 1999 r., mocą której organ ten odmówił Zakładom Techniki Medycznej w K. potrącenia zobowiązania w podatku od towarów i usług za miesiące od kwietnia do lipca 1999 r. z wzajemnej bezspornej i wymagalnej wierzytelności wobec Samodzielnego Publicznego Szpitala Wojewódzkiego w G.
Przedstawiona do potrącenia wierzytelność wynikała z rachunków uproszczonych z 28 grudnia 1998 r. za dostawę urządzeń i usług ich montażu i była bezsporna oraz wymagalna, jednak nie może być uwzględniona, bowiem Samodzielny Publiczny Szpital Wojewódzki w G. od 1 lutego 1998 r. nie jest państwową jednostką budżetową, a tylko wobec takich jednostek wierzytelności mogą - w świetle art. 64 par. 2 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./ być podstawą potrącenia zobowiązania podatkowego.
Przekształcenie Szpitala z państwowej jednostki budżetowej w Samodzielny Publiczny Szpital Wojewódzki w G. nastąpiło na podstawie zarządzenia Wojewody Nr 5 z dnia 30 stycznia 1998 r. z dniem 1 lutego 1998 r. Gospodarka finansowa publicznych zakładów opieki zdrowotnej uregulowana jest w ustawie z dnia 30 sierpnia 1991 r. o zakładach opieki zdrowotnej /Dz.U. nr 91 poz. 408 ze zm./, zgodne z którą zakłady te pozostawiają w swojej dyspozycji uzyskiwane dochody w wielkości uzależnionej od formy prowadzonej gospodarki finansowej, natomiast z budżetu otrzymują dofinansowanie na cele określone w ustawie.
Państwowe jednostki budżetowe podlegają natomiast ustawie o finansach publicznych, która określa ich formy organizacyjno-prawne; jednostki te nie prowadzą samodzielnej gospodarki finansowej, lecz pokrywają wydatki bezpośrednio z budżetu, a uzyskane dochody odprowadzają do budżetu państwa.
W momencie powstania wierzytelności tj. 28 grudnia 1998 r. Szpital nie posiadał już statusu państwowej jednostki budżetowej, tym samym zgłoszona wierzytelność nie mogła być podstawą potrącenia zobowiązania podatkowego.
Od decyzji Izby Skarbowej Zakłady Techniki Medycznej wniosły skargę do Naczelnego Sądu Administracyjnego domagając się jej uchylenia. Skarżący zarzucił, że decyzja narusza jego interes prawny przez to, że nie uwzględniono potwierdzenia wierzytelności Szpitala przez L. Urząd Wojewódzki w G., nie uwzględniono postanowienia Urzędu Skarbowego z 7 kwietnia 1999 r., w którym pozytywnie załatwiono wcześniejszy wniosek w sprawie potrącenia, nie uwzględniono zarządzenia Wojewody Nr 193 z dnia 28 grudnia 1998 r. w sprawie finansowania w formie jednostek budżetowych jednostek, które zostały przekształcone w samodzielne publiczne zakłady opieki zdrowotnej w 1997 r. i 1998 r.
W odpowiedzi na skargę Izba Skarbowa wniosła o jej oddalenie podtrzymując dotychczasowe stanowisko.
Naczelny Sąd Administracyjny zważył, co następuje:
Skarga nie jest zasadna, gdyż zaskarżona decyzja jest zgodna z prawem.