Wniesienie wkładu niepieniężnego do spółki cywilnej nie stanowiło czynności podlegającej opodatkowaniu podatkiem VAT. Dopiero na podstawie art. 1 pkt 1 lit. "b" ustawy z dnia 21 listopada 1996 r. o zmianie ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 137 poz. 640/ nowelizującego art. 2 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 11 poz. 50 ze zm./ przedmiotem opodatkowania podatkiem od towarów i usług stała się kolejna czynność, tj. wydanie towarów lub świadczenie usług w zamian za czynności nie podlegające opodatkowaniu tym podatkiem. Konsekwencją wspomnianej nowelizacji był m.in. obowiązek opodatkowania czynności polegającej na wniesieniu wkładu niepieniężnego do spółek prawa handlowego i cywilnego.
Decyzją z dnia 12 sierpnia 1997 r. Urząd Skarbowy określił Jerzemu U. za styczeń 1997 r. zobowiązanie podatkowe w podatku od towarów i usług w kwocie 24.081 zł oraz ustalił dodatkowe zobowiązanie podatkowe w kwocie 7.224 zł stanowiącej 30 procent zaniżenia zobowiązania podatkowego. Jako podstawę prawną podano art. 10 ust. 2, art. 20 ust. 2, art. 27 ust. 5 ustawy z dnia 9 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 11 poz. 50 ze zm. - zwana dalej ustawą o VAT/. W uzasadnieniu zaś wyjaśniono, że Jerzy U. był od września 1994 r. podatnikiem podatku VAT. W dniu 8 stycznia 1997 r. podatnik zgłosił na druku VAT-Z zaprzestanie wykonywania czynności podlegających opodatkowaniu podatkiem VAT z dniem zgłoszenia tj. z dniem 8 stycznia 1997 r., wykazując "0" wartość zapasu towarów na ten dzień. Równocześnie - co ustalono w toku postępowania kontrolnego - na podstawie aneksu z dnia 3 stycznia 1997 r. do umowy spółki cywilnej podatnik wniósł - jako wkład do utworzonej w dniu 2 grudnia 1996 r. spółki cywilnej - wszystkie posiadane w tym dniu towary handlowe o wartości netto /w cenie zakupu/ 109.505,19 zł. Towary te podatnik zakupił z prawem do odliczenia podatku VAT i podatek ten odliczył. Wnosząc towary jako wkład do Spółki cywilnej podatnik nie naliczył od tego towaru podatku należnego, ani nie pomniejszył podatku naliczonego o podatek odliczony przy zakupie towarów. Z wyjaśnień podatnika wynika, że aportu nie wykazał w deklaracji podatkowej VAT 7 ponieważ uważał, że czynność ta nie podlega przepisom ustawy o VAT. Organ podatkowy uznał, iż podatnik odliczył podatek naliczony w kwocie 24.081 zł z zakupów, które nie były związane ze sprzedażą opodatkowaną lecz związane były z czynnością nie podlegającą opodatkowaniu podatkiem VAT. Odliczenie podatku naliczonego od czynności nie związanych ze sprzedażą opodatkowaną stanowi naruszenie art. 20 ust. 2 cytowanej ustawy o VAT. Dokonując w dniu 3 stycznia 1997 r. wniesienia przedmiotowego towaru jako wkładu niepieniężnego do spółki podatnik winien pomniejszyć podatek naliczony o kwotę 24.081 zł, która została odliczona od przekazanego do spółki towaru. Ponieważ podatnik nie pomniejszył podatku naliczonego i tym samym zaniżył zobowiązanie podatkowe za miesiąc styczeń 1997 r. organ podatkowy - na podstawie art. 27 ust. 5 cytowanej ustawy o podatku VAT - zadeklarowane zobowiązanie podatkowe za miesiąc styczeń 1997 r. zwiększył o kwotę 24.081 zł i dodatkowo ustalił do zapłaty podatek VAT w wysokości 30 procent tego zaniżenia, to jest w kwocie 7.224 zł.
W odwołaniu od powyższej decyzji podatnik podniósł, że wnosząc aport do spółki wykonał czynność, która nie jest wymieniona w art. 2 cytowanej ustawy o podatku VAT. Czynności tej nie należy - jego zdaniem - utożsamiać z czynnościami zwolnionymi, które są wymienione w załączniku do art. 7 cytowanej ustawy o VAT. Towary handlowe, które wniósł do spółki, zostały wycenione i wniesione w cenach netto; służą w całości sprzedaży opodatkowanej.