Zobowiązany do wypłaty odszkodowania za wywłaszczoną nieruchomość jest podmiot, na którego rzecz następuje wywłaszczenie /art. 50 ust. 1 ustawy z dnia 29 kwietnia 1985 r. o gospodarce gruntami i wywłaszczaniu nieruchomości - Dz.U. 1991 nr 30 poz. 127 ze zm./. Jeżeli zatem nieruchomość została wywłaszczona na rzecz Skarbu Państwa, na Skarbie Państwa, a nie na gminie ciąży obowiązek wypłacenia odszkodowania.
Naczelny Sąd Administracyjny uznał zasadność skargi Gminy Ł. na decyzję Wojewody (...) z dnia 8 sierpnia 1994 r. w przedmiocie ustalenia odszkodowania za wywłaszczoną nieruchomość i na podstawie art. 207 par. 1 i 2 pkt 1 Kpa uchylił zaskarżoną decyzję w części dotyczącej zobowiązania Zarządu Miasta Ł. do wypłaty odszkodowania.
W wyniku uchylenia wcześniejszych decyzji wyrokami Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 5 grudnia 1988 r. /IV SA 827/88/ i z dnia 19 grudnia 1989 r. /IV SA 906/89/, uchylającego tylko decyzję II instancji, decyzją Wojewody (...) nr GP.G-III-8221-2/12/88 z dnia 17 stycznia 1991 r. została utrzymana w mocy decyzja Kierownika Wydziału Geodezji i Gospodarki Gruntami Urzędu (...) w Ł. z dnia 1 czerwca 1989 r. w części dotyczącej wywłaszczenia na rzecz Państwa nieruchomości położonej w Ł. przy ul. R. nr 26, o powierzchni 545 m2, oznaczonej numerem 1076, stanowiącej współwłasność Jana R., Zofii Ś., Bolesławy R., Anny R. i J. A. R. Natomiast w części dotyczącej odszkodowania decyzja ta została uchylona, a sprawę w tym zakresie przekazano do ponownego rozpatrzenia Kierownikowi Urzędu Rejonowego w Ł. Decyzja ta nie została zaskarżona do sądu administracyjnego.
Kierownik Urzędu Rejonowego w Ł. decyzją z dnia 5 grudnia 1991 r. ustalił odszkodowanie za wywłaszczoną nieruchomość w wysokości 576 429 513 zł, przy czym od kwoty tej odliczył 136 481950 zł z tytułu przeliczonego odszkodowania wypłaconego wcześniej na podstawie uchylonej decyzji z dnia 23 maja 1988 r. w pierwotnej wysokości 6176 243 zł. W decyzji zaznaczono, że wypłata odszkodowania nastąpi z konta Urzędu Rejonowego.
Decyzja Wojewody (...) z dnia 10 stycznia 1992 r., utrzymująca w mocy wymienioną decyzję Kierownika Urzędu Rejonowego, w wyniku skargi wywłaszczonych współwłaścicieli została uchylona wyrokiem Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 4 grudnia 1992 r. IV SA 224/92.
W trakcie ponownego postępowania odwoławczego, na skutek wezwania skierowanego do Zarządu Miasta Ł. o zapewnienie odpowiedniej kwoty niezbędnej na wypłatę odszkodowania za wywłaszczoną nieruchomość, Urząd Miasta Ł. w piśmie z dnia 15 września 1993 r. wyjaśnił, że wszczęcie postępowania wywłaszczeniowego nastąpiło przed 27 maja 1990 r., a więc przed powstaniem Gminy Miejskiej Ł., na wniosek Wojewódzkiego Przedsiębiorstwa Usług Inwestycyjnych. W toku tego postępowania gmina nie podtrzymywała wniosku inwestora w tym przedmiocie. W 1991 r. Ministerstwo Finansów przyznało Urzędowi Rejonowemu w Ł. 10 mld złotych na sfinansowanie wydatków na odszkodowania nie wypłacone do dnia wejścia w życie ustawy z dnia 29 września 1990 r. o zmianie ustawy o gospodarce gruntami i wywłaszczaniu nieruchomości /Dz.U. nr 79 poz. 464/. W konkluzji uznano, że właściwy do wypłaty odszkodowania jest Skarb Państwa, a nie Gmina.
Na skutek tego pisma, postanowieniem Wojewody (...) z dnia 25 kwietnia 1994 r. z urzędu zawieszono postępowanie w celu rozstrzygnięcia zagadnienia wstępnego dotyczącego nabycia własności wywłaszczonej nieruchomości przez Gminę Ł., zobowiązując jednocześnie Zarząd Miasta Ł. do wystąpienia w terminie dwóch miesięcy z wnioskiem o komunalizację nieruchomości wywłaszczonej na rzecz Państwa. W uzasadnieniu podano, że organ odwoławczy nie podziela stanowiska Urzędu Miasta Ł., wyrażonego w wymienionym piśmie, jednakże uważa, iż dopóki Gmina Ł. nie jest wpisana w księdze wieczystej prowadzonej dla tej nieruchomości na miejsce Skarbu Państwa, dopóty może skutecznie twierdzić, że nie jest stroną postępowania.