Ustawa ta reguluje opodatkowanie od sprzedaży "towarów i usług". Podatnikami podatku VAT zgodnie z art. ww. ustawy są osoby dokonujące m.in. sprzedaży towarów i usług o jakich mowa w ustawie VAT. Skoro "akcje", jako prawa majątkowe, nie są przedmiotem wchodzącym w zakres uregulowań ustawy VAT, to nie może być stosowany do ich sprzedaży art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej, który stanowi, że "opłacie skarbowej nie podlegają umowy sprzedaży zawierane przez podatników VAT" - odesłanie następuje do ustawy "o podatku od towarów i usług" /art. 5/, a tym samym aktu prawnego, który obejmuje konkretnie przedmiot - towar i usługi /akcyzę/ w powiązaniu z podatnikiem, zobowiązanym do uiszczenia podatku VAT od transakcji tymi "towarami i usługami". Stąd też interpretacja art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej (...), że każda umowa sprzedaży, byleby była zawarta między podatnikami VAT jest zwolniona z opłaty skarbowej prowadziłaby do nieuzasadnionej uprzywilejowanej sytuacji osoby będącej podatnikiem VAT, który nie mając obowiązku odprowadzenia podatku VAT od zakupionych akcji, dodatkowo nie uiszczałby opłaty skarbowej od tej czynności. Każda inna osoba - nie podatnik VAT - musiałaby uiścić opłatę skarbową. Brak podstaw, aby podatnika, jako podmiot VAT traktować w sposób bardziej liberalny, niż innych podatników.
Stąd też Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z dnia 20 października 1994 r. SA/Kr 1314/94 zawarł tezę, że ze zwolnień od opłaty skarbowej korzystają tylko te czynności cywilnoprawne, które podlegają podatkowi od towarów i usług. Skoro sprzedaż akcji nie podlega podatkowi VAT, to podlega opłacie skarbowej.
W tym stanie rzeczy, Sąd podzielił stanowisko organów podatkowych, iż skarżący ma obowiązek zapłaty wyliczonej opłaty skarbowej, a zatem na podstawie art. 27 ust. 1 ustawy z dnia 11 maja 1995 r. o Naczelnym Sądzie Administracyjnym /Dz.U. nr 74 poz. 368 ze zm./ skargę należało oddalić.