Ze zwolnienia od opłaty skarbowej, o której mowa w art. 3 ust. 1 pkt 5 zwolnione są umowy sprzedaży, dzierżawy, poddzierżawy, najmu i podnajmu zawierane przez podatników, o których mowa w art. 5 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 11 poz. 50/ oraz inne tego rodzaju umowy, objęte zwolnieniami na podstawie art. 7 ust. 1 pkt 1 i 2, a także umowy sprzedaży zawierane przez podatników, o których mowa w art. 14 tej ustawy w zakresie czynności zwolnionych od podatku.
"O." spółka z o.o. w B. P. kupiła dnia 4 sierpnia 1993 r. od A. K. i A. P. w P. używane maszyny i urządzenia młynarskie za kwotę jeden miliard złotych. Od umowy tej spółka "O." zapłaciła 20 mln zł opłaty skarbowej. Dnia 6 października 1993 r. spółka wystąpiła o zwrot opłaty skarbowej podnosząc, że jest podatnikiem podatku od towarów i usług i w świetle art. 3 ust. 1 pkt 5 ustawy z dnia 31 stycznia 1989 r. o opłacie skarbowej /Dz.U. nr 4 poz. 23 ze zm./ opłata skarbowa pobrana została niesłusznie.
Decyzją z dnia 26 października 1993 r. (...) Urząd Skarbowy w B. P., w oparciu o przepis art. 104 Kpa, art. 3 ust. 1 pkt 5 ustawy o opłacie skarbowej, odmówił zwrotu opłaty skarbowej od umowy kupna maszyn i urządzeń stanowiących wyposażenie młyna uznając, że opłacie skarbowej nie podlegają umowy kupna-sprzedaży, jeżeli strona jest podatnikiem podatku od towarów i usług, tj. osobą, jednostką organizacyjną zobowiązaną do uiszczenia podatku.
W odwołaniu "O." spółka z o.o. wniosła o uchylenie decyzji Urzędu Skarbowego twierdząc, że art. 3 ust. 1 pkt 5 ustawy o opłacie skarbowej stanowi, iż umowy sprzedaży, dzierżawy, poddzierżawy, najmu i podnajmu zawierane przez podatników, o których mowa w art. 5 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym, nie podlegają opłacie skarbowej. Sprzedający prowadzą działalność gospodarczą jako spółka cywilna.
Z analizy art. 5 ustawy o podatku od towarów i usług wynika, zdaniem spółki, że każdy, kto wypełnia jeden z warunków zamieszczonych w tym artykule, jest podatnikiem tego podatku. Dalsze przepisy - art. 7 i art. 14 - określają warunki, kiedy ci podatnicy mogą być zwolnieni od podatku, co nie jest równoznaczne, że przestają być podatnikami.
Izba Skarbowa w B. nie podzieliła poglądów spółki "O." i decyzją z dnia 9 grudnia 1993 r. (...) utrzymała w mocy decyzję Urzędu Skarbowego podnosząc dodatkowo, że przedmiotem przeniesienia własności są maszyny i urządzenia stanowiące wyposażenie młyna. Sam handel tymi maszynami i urządzeniami nie jest zaś przedmiotem działalności osób dokonujących sprzedaży, jest nim działalność młynarska. W związku z powyższym przepis art. 3 ust. 1 pkt 5 ustawy o opłacie skarbowej nie ma zastosowania, gdyż zwalnia on od opłaty skarbowej tylko podatników w zakresie ich czynności.
Od decyzji Izby Skarbowej skargę wniosła "O." spółka z o.o. wnosząc o uchylenie zaskarżonej decyzji. W uzasadnieniu spółka ponownie dokonała interpretacji przepisów art. 3 ust. 1 pkt 5 ustawy o opłacie skarbowej i art. 5 ustawy o podatku od towarów i usług uznając, że skoro z pkt 1 ust. 5 wynika, że każdy, kto ma siedzibę lub miejsce zamieszkania na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, jeżeli wykonuje we własnym imieniu i na własny rachunek czynności, o których mowa w art. 2 - jest podatnikiem podatku od towarów i usług i tym samym nie powinien uiszczać opłaty skarbowej.