Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący sędzia WSA Włodzimierz Gurba, Sędziowie sędzia WSA Ewa Izabela Fiedorowicz, sędzia WSA Aneta Trochim-Tuchorska (sprawozdawca), po rozpoznaniu w trybie uproszczonym w dniu 30 kwietnia 2020 r. sprawy ze skargi M. z o.o. z siedzibą w W. na bezczynność Naczelnika Urzędu Skarbowego [...] w przedmiocie zwrotu nadwyżki podatku od towarów i usług za luty 2015 r. oddala skargę
[...] sp. z o.o. (dalej: "Skarżąca" lub "Spółka") w dniu 25 marca 2015r. (wpływ: 30 marca 2015r.) złożyła deklarację dla podatku od towarów i usług (VAT-7) za luty 2015r. z zadeklarowaną kwotą do zwrotu w wysokości 122.651,00 zł, w terminie 60 dni w trybie art. 87 ust. 2 ustawy z dnia 11 marca 2004r. o podatku od towarów i usług (Dz. U. z 2018r., poz. 2174 ze zm.; dalej: "u.p.t.u.", "ustawa o VAT"). W ww. deklaracji wykazano wewnątrzwspólnotową dostawę towarów w kwocie 569.236,00 zł oraz podatek naliczony do odliczenia w wysokości 132.256,00 zł.
Naczelnik Urzędu Skarbowego W. ("Naczelnik US") postanowieniem z [...] maja 2015r. postanowił przedłużyć termin zwrotu kwoty nadwyżki podatku naliczonego nad należnym za luty 2015r. w kwocie 122.651,00 zł do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia dokonywanego w ramach czynności sprawdzających. Postanowieniem z [...] sierpnia 2015r. Dyrektor Izby Skarbowej w W. ("Dyrektor IS") utrzymał w mocy to postanowienie organu I instancji. Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie wyrokiem z dnia 28 grudnia 2016r., III SA/Wa 2859/15 uchylił zaskarżone postanowienie Dyrektora IS wskazując, że organ podatkowy miał podstawy do powzięcia wątpliwości zmierzających do dodatkowego zweryfikowania zasadności tego zwrotu. Powodem uchylenia zaskarżonego postanowienia, był brak wskazania daty dziennej, do której miał być przedłużony termin zwrotu. Sąd stwierdził, że postanowienie Dyrektora IS naruszało art. 87 ust. 2 u.p.t.u. w zakresie w jakim został zaakceptowany brak określenia przez Naczelnika US terminu do jakiego nastąpiło przedłużenie terminu zwrotu za luty 2015r. Po ponownym zapoznaniu się z materiałem dowodowym zebranym w sprawie z zażalenia Spółki z dnia 3 czerwca 2015r., mając na uwadze wyrok Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie z dnia 28 grudnia 2016r., III SA/Wa 2859/15 Dyrektor IS postanowieniem z dnia [...] czerwca 2017r. uchylił postanowienie organu I instancji w części dotyczącej terminu przedłużenia zwrotu kwoty nadwyżki podatku naliczonego nad należnym, wykazanej w deklaracji VAT-7 za luty 2015r. i stwierdził, iż w postanowieniu organu I instancji jako termin do przedłużenia zwrotu kwoty nadwyżki podatku naliczonego nad należnym za luty 2015r. w kwocie 122.651,00 zł winien być wskazany dzień 2[...] września 2015r., a w pozostałej części utrzymał w mocy postanowienie organu I instancji.
Naczelnik US wszczął kontrolę podatkową wobec Skarżącej w zakresie podatku od towarów i usług za luty 2015r. w związku ze zwrotem podatku.
Następnie Naczelnik US postanowieniem z dnia [...] września 2015r. postanowił przedłużyć termin zwrotu podatku wykazanego w deklaracji dla podatku od towarów i usług (VAT-7) za luty 2015r. do czasu zakończenia weryfikacji rozliczenia podatnika dokonywanego w ramach kontroli podatkowej.