Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Krystyna Kleiber, Sędziowie Sędzia WSA Alojzy Skrodzki (sprawozdawca), Sędzia WSA Aneta Trochim-Tuchorska, Protokolant Maria Nałęcz, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 4 kwietnia 2011 r. sprawy ze skargi S. sp. z o.o. z siedzibą w W. na bezczynność Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w W. w przedmiocie bezczynność organu 1) zobowiązuje Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w W. do wydania rozstrzygnięcia w przedmiocie wniosku o zwrot odsetek od złożonego depozytu, w terminie jednego miesiąca od dnia doręczenia organowi akt administracyjnych sprawy wraz z odpisem prawomocnego wyroku, 2) zasądza od Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w W. na rzecz S. sp. z o.o. z siedzibą w W. kwotę 340 zł (słownie: trzysta czterdzieści złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.
S. sp. z o.o. (Skarżąca), wnioskiem z dnia 2 czerwca 2010 r. zwróciła się do Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w W. o zwrot odsetek od kwoty zabezpieczenia wpłaconego na rachunek sum depozytowych w 2009 r. w związku z zabezpieczeniem zobowiązań podatkowych. W podstawie wniosku wskazała art. 77 § 4 w związku z art. 78 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2005 r. Nr 8 poz. 60 ze zm., dalej: Ordynacja podatkowa). Wyjaśniła, iż w związku z uchyleniem decyzji wymiarowej Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej w W. dotyczącej podatku dochodowego od osób prawnych za 2006 r. i niewydaniem w terminie 30 dni od uchylenia nowej decyzji, Spółce powinien przysługiwać zwrot nadpłaty powiększonej o należne odsetki za okres od 2009 r. do dnia zwrotu.
Do czasu złożenia ww. wniosku postępowanie miało następujący przebieg. W dniu 9 marca 2009 r. do [...] Urzędu Skarbowego w W. wpłynął wniosek Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej w W. o wydanie decyzji w trybie art. 33 Ordynacji podatkowej o zabezpieczeniu na majątku Spółki zobowiązań w podatku dochodowym od osób prawnych za 2006 r. przed wydaniem decyzji określającej wysokość zobowiązania podatkowego.
Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w W. wydał decyzję z dnia [...] marca 2009 r. o zabezpieczeniu na majątku Spółki zobowiązania podatkowego z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych za 2006 r. w wysokości 1.724.090 zł oraz odsetki od tego zobowiązania w wysokości 449.273 zł.
Następnie, w dniu 23 marca 2009 r. wydał zarządzenie zabezpieczenia na kwotę 2.173.369 zł oraz złożył do Sądu Rejonowego dla W. w W. wniosek o wpis w księdze wieczystej, na podstawie którego w dnu 28 lipca 2009 r. dokonane wpisu hipoteki przymusowej kaucyjnej dla nieruchomości stanowiącej własność Spółki na sumę 2.173.679 zł.
Dyrektor Izby Skarbowej w W. decyzją z dnia [...] czerwca 2009 r. utrzymał w mocy decyzję organu podatkowego I instancji z dnia 20 marca 2009 r. o zabezpieczeniu na majątku Spółki.
Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w W., po rozpatrzeniu wniosku wierzyciela, postanowieniem z dnia 23 czerwca 2009 r. przedłużył bezterminowo termin zabezpieczenia dokonanego na majątku Spółki na podstawie zarządzania zabezpieczenia z dnia 23 marca 2009 r.
W dniu 16 lipca 2009 r. do [...] Urzędu Skarbowego w W. wpłynęło pismo Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej w W. z dnia 14 lipca 2009 r. w którym Dyrektor Urzędu Kontroli Skarbowej w W. przychylił się do wniosku z dnia 10 lipca 2009 r. o zmianę sposobu zabezpieczenia zobowiązań w podatku dochodowym od osób prawnych za 2006 r. na zabezpieczenie w formie określonej w art. 33d § 2 pkt 6 lub pkt 7 Ordynacja podatkowa.
Dyrektor Urzędu Kontroli Skarbowej w W. decyzją z dnia [...] lipca 2009 r. określił Spółce zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym od osób prawnych za 2006 r. w wysokości 6.845.517 zł.