Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący sędzia WSA Matylda Arnold-Rogiewicz, Sędziowie sędzia WSA Jarosław Trelka, sędzia WSA Jacek Kaute (sprawozdawca), , po rozpoznaniu w trybie uproszczonym w dniu 30 kwietnia 2020 r. sprawy ze skargi Miejskiego Przedsiębiorstwa Komunikacyjnego w P. Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w P. na postanowienie Szefa Krajowej Administracji Skarbowej z dnia [...] listopada 2019 r. nr [...] w przedmiocie odmowy wszczęcia postępowania w sprawie nadania numeru schematu podatkowego 1) uchyla zaskarżone postanowienie oraz poprzedzające je postanowienie Szefa Krajowej Administracji Skarbowej z dnia [...] września 2019 r. nr [...], 2) zasądza od Szefa Krajowej Administracji Skarbowej na rzecz Miejskiego Przedsiębiorstwa Komunikacyjnego w P. Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w P. kwotę 100 zł (słownie: sto złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.
W dniu [...] stycznia 2019 r. Miejskie Przedsiębiorstwo Komunikacyjne w P. Sp. z o.o.(dalej: "Skarżąca", "Spółka") przekazało do Szefa Krajowej Administracji Skarbowej (dalej: Szef KAS") dokument "MDR-3 Informacja korzystającego o schemacie" (ID: [...]). Powyższy dokument został podpisany przez Panią E. S.
W dniu 4 lutego 2019 r. Szef KAS zwrócił się do Spółki z prośbą o uzupełnienie informacji poprzez podanie adresu ePUAP, wskazując, że w informacji wartość "173500" nie spełnia wymogów dla doręczenia za pomocą środków komunikacji elektronicznej.
W dniu [...] lutego 2019 r. Spółka złożyła dokument "MDR-3 Informacja korzystającego o schemacie" (ID: [...]), w którym jako cel złożenia wskazano "uzupełnienie informacji" oraz jako identyfikator dokumentu uzupełnianego - ID: [...] (tj. dokument "MDR-3 Informacja korzystającego o schemacie podatkowym" przekazany w dniu 31 stycznia 2019 r.). Powyższy dokument został podpisany przez Panią E. S.
W dniu [...] lutego 2019 r. Szef KAS w związku z przekazanym w dniu [...] lutego 2015 r. uzupełnieniem informacji "MDR-3 Informacja korzystającego o schemacie podatkowym" (ID: [...]) wezwał Spółkę do przekazania w terminie 7 dni, za pomocą środków komunikacji elektronicznej w postaci odpowiadającej strukturze logicznej, o której mowa w art. 86n §2 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2019 r. poz. 900, z zm., dalej: "O.p.") uzupełnienia dokumentu "MDR-3 Informacja korzystającego o schemacie podatkowym" za okres od 1 stycznia 2019 do 31 stycznia 2019, podpisanego przez wszystkich członków zarządu.
W dniu [...] lutego 2019 r. Spółka złożyła dokument "MDR-1 informacja o schemacie" (ID: [...]), w którym jako cel złożenia wskazano "uzupełnienie informacji" oraz jako identyfikator dokumentu uzupełnianego - ID: [...] (tj. dokument "MDR-3 Informacja korzystającego o schemacie " przekazany w dniu 31 stycznia 2019 r.). Powyższy dokument został podpisany przez Panią E. S.
W dniu [...] marca 2019 r. Pani E. S. (Główny Księgowy Spółki) złożyła pismo stanowiące odpowiedź na pismo Szefa KAS dotyczące uzupełnienia ww. informacji "MDR-3 informacja korzystającego o schemacie podatkowym" (ID [...]) informując, że działając w dobrej wierze i dokładając wszelkich starań, aby sprostać nowym przepisom o raportowaniu schematów, dopiero po wydaniu objaśnień Ministerstwa Finansów w sprawie schematów podatkowych, które ukazały się dla użytku publicznego dopiero 1 lutego 2019 roku, zorientowała się, że złożyła zły wzór informacji korzystającego o schemacie podatkowym. Celem Spółki było wypełnienie obowiązku raportowania uzgodnień, które mogą być uznane za tzw. schemat, a nie złożenie deklaracji uzupełniającej do deklaracji podatkowej (CIT), która w tym czasie nie jest składana. W związku z powyższym Spółka uzupełnia zgłoszenie z 31 stycznia 2019 na właściwym MDR-1, stosownie do informacji zawartej w objaśnieniach MF. W takim wypadku, zdaniem Spółki, nie ma potrzeby uzupełniania formularza MDR-3 o podpisy członków Zarządu Spółki.