Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Jakub Pinkowski (spr.), Sędziowie Asesor WSA Sylwester Golec, Asesor WSA Alojzy Skrodzki, Protokolant Anna Kurdej, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 23 kwietnia 2007 r. sprawy ze skargi E. Sp. z o. o. w W. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w W. z dnia ... lipca 2006 r. nr ... w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych 1) uchyla zaskarżoną decyzję, 2) stwierdza, że uchylona decyzja nie podlega wykonaniu w całości, 3) zasądza od Dyrektora Izby Skarbowej w W. na rzecz E. Sp. z o. o. kwotę 11.055 zł (słownie: jedenaście tysięcy pięćdziesiąt pięć złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.
Zaskarżoną decyzją z dnia ... lipca 2006 r. Dyrektor Izby Skarbowej w W. (DIS), po rozpatrzeniu odwołania E. Sp. z o.o., zwanej dalej Spółką, utrzymał w mocy decyzję Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego z ... marca 2006 r. w przedmiocie stwierdzenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych.
Z akt rozpoznawanej sprawy wynika, iż w dniu ... lipca 2004 r. spółka prawa [...], E., dalej zwana spółką [...], oraz Spółka zawarły umowę "przeniesienia biznesu". Na mocy tej umowy Spółka zbyła na rzecz spółki [...] prawo własności "Aktywów" i "Kontraktów". Przez pojęcie "Aktywów" przenoszonych na nabywcę strony umowy rozumiały aktywa zarówno rzeczowe, jak i wartości niematerialne i prawne szczegółowo opisane w wykazie B stanowiącym załącznik do umowy. Z kolei przez pojęcie "Kontraktów" rozumiały - Kontrakty z Klientami i Kontrakty z Dostawcami, szczegółowo określone w wykazie A. Od tej umowy Spółka zapłaciła podatek od czynności cywilnoprawnych w kwocie l.769.878,60 zł oraz złożyła deklarację PCC-1.
W dniu ... grudnia 2004 r. Spółka wystąpiła do Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w W. z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie 1.769.878,60 zł. Jej zdaniem, podatek został zapłacony nienależnie, ponieważ umowa ta nie podlega opodatkowaniu tym podatkiem na podstawie art. 2 pkt 4 ustawy z dnia 9 września 2000 r. o podatku od czynności cywilnoprawnych (Dz.U. nr 41, poz. 3999, ze zm. dalej - uopcc).
Naczelnik Urzędu Skarbowego stwierdził nadpłatę podatku w kwocie 257.750,20 zł - w części dotyczącej podatku uiszczonego z tytułu sprzedaży towarów. Jednocześnie odmówił stwierdzenia nadpłaty podatku w kwocie 1.512.128,40 zł - w części dotyczącej podatku zapłaconego z tytułu przeniesienia praw wynikających z kontraktów oraz z tytułu zbycia praw majątkowych. Spółka złożyła odwołanie od decyzji w części dotyczącej odmowy stwierdzenia nadpłaty. DIS stwierdzając, że orzeczenie co do istoty sprawy nie jest możliwe z uwagi na konieczność uzupełnienia materiału dowodowego w znacznej części, uchylił zaskarżoną decyzję kierując sprawę do ponownego rozpatrzenia.
W wyniku ponownego rozpatrzenia sprawy organ I instancji ustalił, że przedmiotem umowy "przeniesienia biznesu" były rzeczy i prawa majątkowe, w tym wierzytelności o wartości 40.697.738,16 zł. Wierzytelności te zgodnie z wyjaśnieniami Spółki dzieliły się na wierzytelności własne wynikające z udzielonych przez nią pożyczek oraz prawa wynikające z umów o świadczenie usług reklamy i promocji.
Decyzją z dnia ... marca 2006 r. Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego stwierdził nadpłatę podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie 1.126.709,40 zł w części dotyczącej podatku uiszczonego z tytułu sprzedaży praw wynikających z zawartych umów dystrybucyjnych oraz zawartych przez Spółkę umów o świadczenie usług reklamy i promocji, oraz odmówił stwierdzenia nadpłaty podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie 385.419,00 zł - w części dotyczącej podatku uiszczonego z tytułu przeniesienia wierzytelności własnych Spółki. W uzasadnieniu decyzji organ I instancji wskazał, że Spółka, dokonując odpłatnego przeniesienia praw wynikających z zawartych przez nią umów dystrybucyjnych oraz umów o świadczenie usług reklamy i promocji, działała w ramach prowadzonej przez siebie działalności gospodarczej. W związku tym, po jej stronie powstał obowiązek podatkowy w podatku od towarów i usług, co oznacza, że podatek od czynności cywilnoprawnych zapłacony w kwocie 1.126.709,40 zł uiściła nienależnie. Natomiast podatek w kwocie 385.419,00 zł zapłacony z tytułu zbycia wierzytelności własnych jest podatkiem należnym, ponieważ ich sprzedaż nastąpiła w oderwaniu od rzeczywistej działalności gospodarczej spółki i nie podlegała opodatkowaniu podatkiem VAT.