Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Krystyna Kleiber, Sędziowie Sędzia WSA Alojzy Skrodzki, Sędzia WSA Aneta Trochim-Tuchorska (sprawozdawca), Protokolant Maria Nałęcz, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 4 kwietnia 2011 r. sprawy ze skargi A. - [...] "S." na decyzję Generalnego Inspektora Kontroli Skarbowej przy Ministrze Finansów z dnia [...] września 2010 r. nr [...] w przedmiocie stwierdzenia nieważności decyzji w zakresie podatku od towarów i usług za okres od stycznia 1999 r. do listopada 2000 r. oddala skargę
Zaskarżoną do Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie decyzją z dnia [...] września 2010 r. Generalny Inspektor Kontroli Skarbowej, działając na podstawie art. 233 § 1 pkt 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz. U. z 2005 r. Nr 8, poz. 60 ze zm.; dalej "O.p.") i art. 26 ust. 2 i 4 w związku z art. 31 ust. 1 i 2 ustawy z dnia 28 września 1991 r. o kontroli skarbowej (Dz. U. z 2004 r. Nr 8, poz. 65 ze zm.), utrzymał w mocy decyzję Generalnego Inspektora Kontroli Skarbowej z dnia [...] czerwca 2010r., stwierdzającą nieważność decyzji ostatecznej Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej w G. z dnia [...] grudnia 2006 r., nr [...] wydanej dla Skarżącej A. prowadzącej działalność gospodarczą pod nazwą [...] "S." w przedmiocie podatku od towarów i usług za poszczególne miesiące od stycznia 1999 r. do listopada 2000 r.
Decyzja została oparta na następująco ustalonym stanie faktycznym i prawnym sprawy.
Dyrektor Urzędu Kontroli Skarbowej w G. (dalej Dyrektor UKS w G.) wszczął postanowieniem z dnia [...] lipca 2002 r., nr [...] postępowanie kontrolne w A. z/s G.. Zakres kontroli obejmował badanie prawidłowości rozliczeń z budżetem [...] "S." za 2000 r.
Postanowieniem z dnia [...] lipca 2002 r. Dyrektor UKS w G. zmienił treść upoważnienia do przeprowadzenia czynności kontrolnych prowadzonych w A., poprzez rozszerzenie zakresu ww. kontroli skarbowej o rozliczenia z budżetem za 2001 r.
Następnie postanowieniem z dnia [...] października 2002 r. Dyrektor UKS w G. ponownie zmienił treść upoważnienia poprzez rozszerzenie zakresu kontroli na badanie prawidłowości rozliczeń z budżetem [...] "S." i Radia P. za lata 1999-2000 i 2001, a postanowieniem z dnia [...] czerwca 2003 r. rozszerzył zakres kontroli skarbowej o rozliczenia podatku od towarów i usług za miesiące styczeń-kwiecień 2002 r. w [...] "S.".
W dniu 7 sierpnia 2003 r. doręczono Skarżącej protokół kontroli, który podpisał jej pełnomocnik. Skarżąca złożyła zastrzeżenia i wyjaśnienia do protokołu kontroli, a następnie wnioskiem z dnia 5 września 2003 r., wniosła o zawieszenie postępowania kontrolnego, gdyż w jej ocenie, rozpoznanie sprawy i wydanie decyzji w sprawie uzależnione jest od rozstrzygnięcia zagadnienia wstępnego przez sąd.
Postanowieniem z dnia [...] listopada 2003 r. Dyrektor UKS w G. zawiesił na podstawie art. 201 § 1 pkt 2 O.p. postępowanie kontrolne.
Wnioskiem z dnia 24 stycznia 2006 r. Skarżąca wniosła o podjęcie zawieszonego postępowania, wskazując że w jej ocenie ustały przesłanki stanowiące podstawę zawieszenia.
Dyrektor UKS w G. postanowieniem z dnia [...] marca 2006 r. podjął z urzędu ww. postępowanie.
Ze względu jednakże na przedawnienie zobowiązań podatkowych w podatku dochodowym od osób prawnych za 1999 r. oraz w podatku od towarów i usług za poszczególne miesiące od stycznia 1999 r. do listopada 2000 r., Dyrektor UKS w G. postanowieniem z dnia [...] lipca 2006 r. zakończył na podstawie art. 24 ust. 1 pkt 3 ustawy o kontroli skarbowej postępowanie kontrolne nr [...] we wskazanym zakresie.