Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodnicząca Sędzia WSA Marta Waksmundzka-Karasińska, Sędziowie Sędzia WSA Maciej Kurasz (sprawozdawca), Sędzia WSA Jarosław Trelka, Protokolant referent stażysta Katarzyna Smaga, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 24 kwietnia 2013 r. sprawy ze skargi Gminy B. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w W. z dnia [...] sierpnia 2012 r. nr [...] w przedmiocie określenia kwoty zwrotu nienależnie otrzymanego podatku od czynności cywilnoprawnych oddala skargę
1. Z przedłożonych Wojewódzkiemu Sądowi Administracyjnemu w Warszawie akt sprawy wynikało, iż w dniu 1 września 2006 r. notariusz jako płatnik podatku od czynności cywilnoprawnych pobrał podatek w wysokości 1.767.025,00 zł z tytułu podwyższenia kapitału zakładowego firmy P. Sp. z o.o. z siedzibą w B. (dalej jako: "Spółka"). W związku z przekazaniem w dniu 18 października 2006 r. Gminie B. (dalej: "Strona" lub "Skarżąca") ww. podatku, zgodnie z art. 4 ust. 1 pkt 1 lit. h ustawy z dnia 13 listopada 2003 r. o dochodach jednostek samorządu terytorialnego (tekst jedn. Dz. U. z 2010 r. Nr 80, poz. 526 ze zm. - dalej jako: "u.d.j.s.t.") Spółka wnioskiem z dnia 21 maja 2009 r. wystąpiła do Naczelnika [...] Urzędu Skarbowego w R. o stwierdzenie nadpłaty podatku od czynności cywilnoprawnych uznając, że podatek od podwyższenia kapitału został pobrany nienależnie.
2. Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w R. decyzją z dnia [...] lipca 2009 r. odmówił Spółce stwierdzenia nadpłaty podatku w żądanej wysokości. Następnie Dyrektor Izby Skarbowej w W. po rozpatrzeniu odwołania decyzją z dnia [...] października 2009 r. uchylił decyzję organu pierwszej instancji i stwierdził nadpłatę w podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie 1.767.025,00 zł na rzecz P.S.A. z siedzibą w B. (następcy prawnego P. Sp. z o.o.). W związku z powyższym Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w R. w dniu 23 października 2009 r. dokonał zwrotu ww. kwoty na rzecz Spółki. Pismem z dnia 17 listopada 2009 r. Skarżąca została poinformowana o konieczności zwrotu organowi podatkowemu równowartości wpłaconej kwoty jako kwoty nienależnie otrzymanych dochodów. Organ pierwszej instancji kolejnym pismem z dnia 17 października 2011 r. poinformował, iż na dzień 17 października 2011 r. nadpłacone środki pieniężne z tytułu wpływów z podatku od czynności cywilnoprawnych wynoszą 1.719.919,35 zł, a termin ich zwrotu upływa z dniem 31 grudnia 2011 r.
3. Naczelnik [...] Urzędu Skarbowego w R., z uwagi na to, iż środki te nie zostały zwrócone do końca 2011 r., postanowieniem z dnia [...] stycznia 2012 r. wszczął z urzędu postępowanie wobec Gminy B. w sprawie określenia zwrotu nienależnie otrzymanych w 2006 r. środków pieniężnych z tytułu podatku od czynności cywilnoprawnych.
4. Organ pierwszej instancji decyzją z dnia [...] marca 2012 r. określił Skarżącej kwotę zwrotu nienależnie otrzymanego podatku od czynności cywilnoprawnych w wysokości 1.718.411,35 zł. W uzasadnieniu wskazał, iż Strona na dzień 31 grudnia 2011 r. nie dokonała zwrotu nienależnie otrzymanej kwoty 1.718.419,35 zł na rachunek bankowy [...] Urzędu Skarbowego w R.. W związku z czym zgodnie z art. 17 ust. 2 u.d.j.s.t. jest zobowiązana do jednorazowego zwrotu nienależnie otrzymanej kwoty wraz z odsetkami za zwłokę naliczonymi od dnia 1 stycznia 2012 r.