Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Jerzy Płusa, Sędzia WSA Grażyna Nasierowska, Asesor WSA Alojzy Skrodzki (spr.), Protokolant Małgorzata Szamocka, po rozpoznaniu w dniu 8 marca 2005 r. sprawy ze skargi Towarzystwa [...] S.A. na decyzję Ministra Finansów z dnia [...] października 2001 r. Nr [...] w przedmiocie odmowy stwierdzenia nieważności decyzji o podatek od towarów i usług za październik 1995 r. -oddala skargę- ic
Naczelny Sąd Administracyjny w Warszawie wyrokiem z dnia 23 września 2004 r. o sygn. akt FSK 640/04 uchylił wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 10 września 2003 r. sygn. akt III SA 376/03, który z kolei uchylał decyzję Ministra Finansów z dnia [...] października 2001 r. nr [...] utrzymującą w mocy własną decyzję Ministra Finansów z dnia [...] lipca 2001 r. odmawiającą stwierdzenia nieważności ostatecznej decyzji Izby Skarbowej w Z. z dnia [...] grudnia 2000 r. Nr [...] uchylającą decyzję organu I instancji w części dotyczącej podatku należnego, określającej w podatku od towarów i usług za październik 1995 r. prawidłową kwotę zwrotu różnicy podatku, kwotę zawyżenia nadwyżki podatku naliczonego nad należnym, zaległość podatkową, wraz z odsetkami od tej zaległości i ustalającej dodatkowe zobowiązanie podatkowe w wysokości 37.618,50 zł oraz utrzymującej w pozostałej części zaskarżoną decyzję organu I instancji w mocy,
Uchylając zaskarżony wyrok Naczelny Sąd Administracyjny w Warszawie przekazał sprawę Wojewódzkiemu Sądowi Administracyjnemu w Warszawie do ponownego rozpoznania, w oparciu o art. 185 § 1 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi (Dz. U. Nr 153, poz. 1270 ze zm.). zwanej dalej "p.p.s.a."
Z przebiegu postępowania wynika, że w dniu [...] września 2000 r. [...] Urząd Skarbowy w Z. po przeprowadzeniu kontroli podatkowej w zakresie prawidłowości rozliczeń z budżetem państwa za 1995 r. w Towarzystwie [...] S.A. Zakład Pracy Chronionej w Z. wydał decyzję w przedmiocie podatku od towarów i usług za październik 1995 r. Decyzja ta określała prawidłową kwotę nadwyżki podatku naliczonego nad należnym podlegającą zwrotowi, wysokość kwoty podatku wynikająca z art. 33 ustawy o VAT oraz zaległość podatkową wraz z odsetkami za zwłokę liczonymi na dzień wydania decyzji.
Od decyzji tej oraz pozostałych za poszczególne miesiące 1995 r. zostały wniesione odwołania, w których zarzucono wadliwość przeprowadzonego postępowania podatkowego i wnioskowano o uchylenie zaskarżonej decyzji. Po wniesieniu odwołania pełnomocnik Spółki zgłosił nowe wnioski dowodowe dotyczące przesłuchania świadków i zasięgnięcia opinii biegłego oraz wyłączenia z materiału dowodowego dokumentów przekazanych przez Prokuraturę Rejonową w Z.. Wnioski te nie zostały uwzględnione i Izba Skarbowa w Z. wydała w tej sprawie postanowienia z [...], [...] i [...] grudnia 2000. o stosownych numerach. Nie został również uwzględniony złożony wniosek o zawieszenie postępowania odwoławczego. W dniu [...] grudnia 2000 r. Izba Skarbowa w Z. po rozpoznaniu odwołania dotyczącego października 1995 r. uchyliła w części decyzję [...] Urzędu Skarbowego w Z., określiła prawidłową kwotę zwrotu podatku, ustaliła dodatkowe zobowiązanie podatkowe oraz określiła odsetki od nienależnego zwrotu..
Następnie w dniu [...] lutego 200l r. do Ministerstwa Finansów wpłynęło zażalenie na postanowienie Izby Skarbowej w Z. z dnia [...] grudnia 2000 r. odmawiające zawieszenia postępowania odwoławczego w przedmiocie podatku od towarów i usług za miesiące od lipca do grudnia 1995r. wraz z wnioskiem pełnomocnika Spółki o stwierdzenie nieważności ostatecznych decyzji Izby Skarbowej utrzymujących w mocy decyzje [...] Urzędu Skarbowego w Z. w sprawie podatku od towarów i usług za miesiące od lipca do grudnia 1995 r.. Wniosek o stwierdzenie nieważności był kilkakrotnie uzupełniany i poparty został opiniami prawnymi a zarzut rażącego naruszenia prawa tj. art. 33 ust. 1 ustawy z dnia 8 stycznia 1993r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym (Dz. U. Nr 11, poz. 50 ze zm.) -zwanej dalej "ustawą o VAT"- pojawił się w piśmie z dnia [...] lutego 2001r. Z kolei w piśmie z dnia [...] marca 2001r. pełnomocnik Spółki złożył alternatywny wniosek o uchylenie decyzji Izby Skarbowej i poprzedzających je decyzji organu I instancji, zaś w piśmie z [...] lipca 2001r. ponownie wrócił on do żądania stwierdzenia nieważności wymienionych decyzji podnosząc również błędną interpretację § 1 ust. 1 zarządzenia Ministra Finansów z dnia 28 grudnia 1994r. w sprawie zaniechania poboru podatku od towarów i usług od zakładów pracy chronionej (MP z 1995r. nr 2, poz. 27) - zwanego dalej "zarządzeniem. Min. Fin. z dnia 28 grudnia 1994 r." - w zw. z art. 33 ust. 1 powołanej ustawy o VAT. Ponadto wnioskodawca zarzucił także rażące naruszenie art. 68 § 1 Ord. pod., ponieważ dodatkowe zobowiązanie przedawniło się po upływie 3 lat.