Dyrektor Izby Skarbowej w W. postanowieniem z dnia [...] czerwca 2011 r. utrzymał w mocy postanowienie organu pierwszej instancji.
W uzasadnieniu wskazał, że postępowanie kontrolne to prawnie uregulowany ciąg czynności procesowych, podejmowanych przez organy kontroli skarbowej, zmierzających do rozpoznania i rozstrzygnięcia sprawy. Jednym z założeń powyższego postępowania, wynikającym z zasady celowości, jest jego ciągły charakter, co oznacza, że powinno się ono toczyć bez przerwy, od momentu jego wszczęcia, aż do załatwienia sprawy. Ponieważ istnieją sytuacje, w których z przyczyn faktycznych lub prawnych nie można w danym momencie kontynuować postępowania, instytucja zawieszenia postępowania służy pogodzeniu zasady ciągłości postępowania z koniecznością czasowego zaniechania jego prowadzenia. Zasadą pozostaje jednakże prowadzenie postępowania w sposób ciągły, umożliwiający sprawne i możliwie szybkie rozpoznanie sprawy - stad też zawieszenie postępowania może mieć miejsce tylko w przypadkach określonych w przepisach prawa.
Dyrektor Izby Skarbowej zauważył, że instytucję zawieszenia postępowania z urzędu uregulowano w art. 201 i następnych ustawy O.p. W treści art. 201 § 1 O.p. wskazano enumeratywnie przypadki, w których zawieszenie postępowania podatkowego jest obligatoryjne. Oznacza to, że w razie wystąpienia przynajmniej jednej z wymienionych tam przesłanek organ podatkowy ma obowiązek zawiesić postępowanie podatkowe niezależnie od tego, na jakim etapie się ono znajduje. Na mocy art. 31 ust. 1 ustawy o kontroli skarbowej do postępowań kontrolnych prowadzonych przez organy kontroli skarbowej w zakresie nieuregulowanym w ustawie o kontroli skarbowej stosuje się przepisy O.p.
Organ drugiej instancji wyjaśnił, że Dyrektor Urzędu Kontroli Skarbowej w W., działając na podstawie art. 201 O.p., odmówił zawieszenia postępowania kontrolnego z uwagi na fakt, iż jego zdaniem w prowadzonym postępowaniu nie zachodzą okoliczności powodujące konieczność rozstrzygnięcia zagadnienia wstępnego przez inny organ lub sąd, a więc nie wystąpiła przesłanka, wymieniona w art. 201 § 1 pkt 2 O.p., obligująca organ podatkowy do zawieszenia postępowania. Postępowanie kontrolne prowadzone jest w sprawie określenia zobowiązania podatkowego za badany okres w prawidłowej wysokości, natomiast w postępowaniu karnym skarbowym określana jest wina w związku z zarzutami postawionymi w postępowaniu karnym. Wydanie orzeczenia merytorycznego w sprawie będącej przedmiotem postępowania, nie jest w żaden sposób uwarunkowane uprzednim rozstrzygnięciem wstępnego zagadnienia prawnego w ramach postępowania karnego skarbowego.
Dyrektor Izby Skarbowej podzielił stanowisko organu pierwszej instancji. Wskazał, że zagadnienie wstępne (prejudycjalne) dotyczy z reguły sytuacji, gdy rozstrzygnięcie merytoryczne sprawy będącej przedmiotem postępowania uzależnione jest od rozstrzygnięcia zagadnienia materialnoprawnego, które należy do kompetencji innego organu administracyjnego lub sądu i nie było wcześniej prawomocnie przesądzone. Innymi słowy, z zagadnieniem wstępnym mamy do czynienia jedynie wówczas, gdy rozstrzygnięcie sprawy podatkowej uwarunkowane jest uprzednim rozstrzygnięciem kwestii prawnej. Nie powstaje zatem w przypadku, gdy na rozpatrzenie i wydanie decyzji podatkowej mogą mieć wpływ ustalenia faktyczne dokonane przez inny organ lub sąd. Jeżeli "zagadnienie wstępne" wykazuje jedynie pośredni związek z rozpatrzeniem sprawy i wydaniem decyzji, nie ma ono charakteru zagadnienia wstępnego. Mogą wiązać się z nim określone skutki procesowe, ale powstanie takiego "zagadnienia" nie rodzi obowiązku zawieszenia postępowania podatkowego (wyrok NSA z dnia 24 czerwca 2010 r., I FSK 1025/09, LEX nr 593474). Jest to więc kwestia o charakterze otwartym, tj. jeszcze nie przesądzona, której treścią może być wypowiedź, co do uprawnienia lub obowiązku, stosunku lub zdarzenia prawnego albo inne okoliczności mające znaczenie prawne dla konkretnej sprawy (Komentarz do art. 201 ustawy Ordynacja podatkowa w: C. Kosikowski, L. Etel, R. Dowgier, R Pietrasz, S. Presnarowicz, M. Popławski, Ordynacja podatkowa. Komentarz, Lex, 2009, v/yd. !!!; wyrok WSA w Gliwicach z dnia 16 września 2009 r., III SA/GI 797/09).