Nie podlegają opłacie skarbowej czynności cywilnoprawne w postaci umowy sprzedaży towarów zawierane przez podatników, o których mowa w art. 5 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 11 poz. 50 ze zm./.
Oznacza to, że wyłączona od opłaty skarbowej jest również sprzedaż towarów używanych, o której mowa w art. 5 ust. 1 pkt 5 tej ustawy dokonywana pomiędzy podmiotami będącymi podatnikami tego podatku.
W dniu 31.05.1997 r. "K." Spółka z o. o. zakupiła od "D." Spółka z o.o. m.in. środki trwałe o wartości 20.069.450 zł wymienione w fakturze VAT z tej samej daty, które będąc towarami używanymi korzystały ze zwolnienia z podatku VAT na podstawie art. 7 ust. 1 pkt 5 ustawy z dnia 8 stycznia 1993 r. o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 11 poz. 50 ze zm./ - dalej zwaną ustawą o VAT. Urząd Skarbowy decyzją z 10.09.1997 r. określił opłatę skarbową od powyższej umowy sprzedaży w wysokości 401.389 zł.
Od tej decyzji Spółka "K." wniosła odwołanie kwestionując zasadność objęcia umowy sprzedaży opłatą skarbową z powołaniem się na treść art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy z dnia 31 stycznia 1989 r. o opłacie skarbowej /Dz.U. nr 4 poz. 23 ze zm./.
Odwołująca się wywodziła, iż omawiana transakcja była zwolniona od opłaty skarbowej, gdyż jej przedmiotem były towary używane w rozumieniu art. 7 ust. 5 ustawy o VAT, których zakup jest zwolniony przedmiotowo od tego podatku. Zarówno sprzedający jak i kupujący są podatnikami VAT w rozumieniu art. 5 ustawy o VAT, a zakupione towary używane stanowiły składniki majątkowe związane z działalnością gospodarczą prowadzoną przez obu podatników. Odmienna interpretacja prowadziłaby do sytuacji, w której czynności zwolnione na mocy art. 7 ust. 1 i 2 ustawy o VAT oraz czynności zwolnione na podstawie innych przepisów tej ustawy byłyby inaczej traktowane z punktu widzenia opłaty skarbowej - pierwsze byłyby od tej opłaty zwolnione, a drugie nie. W związku z tym Spółka wniosła o uznanie nieistnienia obowiązku uiszczenia opłaty skarbowej i zwrot tej opłaty, którą zapłaciła.
Decyzją z dnia 4.12.1997 r. Izba Skarbowa utrzymała w mocy decyzję Urzędu Skarbowego z dnia 10.09.1997 r.
W uzasadnieniu tej decyzji podano, że zgodnie z art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej nie podlegają tej opłacie m.in. umowy sprzedaży zawierane przez podatników VAT tj. podmioty, które z tytułu danej umowy sprzedaży naliczają VAT lub go nie naliczają, ale tylko ze względu na zwolnienia przewidziane w art. 7 ust. 1 pkt 1 i 2 ustawy o VAT oraz gdy są to umowy sprzedaży zawierane przez podatników zwolnionych podmiotowo z VAT /art. 14 ustawy o VAT/.
W pozostałym zakresie umowy sprzedaży podlegają opłacie skarbowej. Taka sytuacja miała miejsce w niniejszej sprawie, gdyż od umowy nie został naliczony podatek VAT i nie korzystała ona ze zwolnienia przewidzianego w art. 7 ust. 1 pkt 1 i 2 ustawy o VAT ani ze zwolnienia przewidzianego w art. 14 tej ustawy. W skardze na decyzję Izby Skarbowej pełnomocnik Spółki "K." wniosła o jej uchylenie oraz poprzedzającej ją decyzji Urzędu Skarbowego i o zwrot uiszczonej opłaty skarbowej w kwocie 436.141,50 zł. /wraz z odsetkami/. Skarżąca zarzuciła, że Izba Skarbowa nie ustosunkowała się do argumentacji podatnika i dokonała błędnej wykładni art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej. Prawidłowa interpretacja tego przepisu powinna doprowadzić do wniosku, że przepis ten zawiera 3 rodzaje zwolnień z opłaty skarbowej, tj.: