Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący Sędzia NSA Andrzej Skoczylas Sędzia NSA Małgorzata Rysz Sędzia del. WSA Marek Krawczak (spr.) Protokolant Monika Majak po rozpoznaniu w dniu 22 września 2022 r. na rozprawie w Izbie Gospodarczej skargi kasacyjnej Ministra Przedsiębiorczości i Technologii od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie z dnia 28 listopada 2018 r. sygn. akt VI SA/Wa 1642/18 w sprawie ze skargi P. Sp. z o.o. w B. na decyzję Ministra Przedsiębiorczości i Technologii z dnia 6 marca 2018 r. nr 46/DI/18 w przedmiocie stwierdzenia nieważności zezwolenia na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej 1) oddala skargę kasacyjną; 2) zasądza od Ministra Rozwoju i Technologii na rzecz P. Sp. z o.o. w B. 240 zł (dwieście czterdzieści złotych) tytułem zwrotu kosztów postępowania kasacyjnego.
Wyrokiem z dnia 28 listopada 2018 r., sygn. akt VI SA/Wa 1642/18, Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie po rozpoznaniu skargi P. Sp. z o.o. z siedzibą w B. (dalej: "Strona", "Spółka", "Skarżąca") na decyzję Ministra Przedsiębiorczości i Technologii z dnia 6 marca 2018 r. nr 46/DI/18 w przedmiocie stwierdzenia nieważności zezwolenia na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej w pkt 1 uchylił zaskarżoną decyzję oraz utrzymaną nią w mocy decyzję Ministra Rozwoju i Finansów nr 290/DI/16 z dnia 30 grudnia 2016 r.; w pkt 2 umorzył postępowanie administracyjne; w pkt 3 zasądził od Ministra Przedsiębiorczości i Technologii na rzecz Skarżącej kwotę 697 złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania.
Stan faktyczny i prawny sprawy przedstawiał się następująco.
Minister Przedsiębiorczości i Technologii (dalej: "Minister", "MPiT") decyzją z 6 marca 2018 r. nr 46/DI/18, na podstawie art. 138 § 1 pkt 1 w związku z art. 127 § 3 ustawy z dnia 14 czerwca 1960 r. Kodeks postępowania administracyjnego (Dz. U. z 2017 r. poz. 1257, dalej: "K.p.a.") w związku z art. 16 ustawy z dnia 7 kwietnia 2017 r. o zmianie ustawy - Kodeks postępowania administracyjnego oraz niektórych innych ustaw (Dz. U z 2017r., poz. 953) oraz art 8 ust. 3 rozporządzenia Komisji (WE) nr 800/2008 z dnia 6 sierpnia 2008 r. w sprawie stosowania art. 87 i 88 Traktatu w odniesieniu do regionalnej pomocy inwestycyjnej (Dz. Urz. UE L 214/3 z dnia 9 sierpnia 2008 r., dalej: "rozporządzenie Komisji"), utrzymał w mocy decyzję Ministra Rozwoju i Finansów nr 290/DI/16 z 30 grudnia 2016 r. stwierdzającą nieważność zezwolenia nr [...] z [...] lutego 2013 r. na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie W. Specjalnej Strefy Ekonomicznej I. udzielonego przedsiębiorcy P[1]. sp. z o.o. z siedzibą w B.
W zaskarżonej decyzji Minister wyjaśnił, że Spółka uzyskała [...] lutego 2013 r., zezwolenie nr [...] na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie W. Specjalnej Strefy Ekonomicznej I. Pismem z 31 marca 2016 r. Minister Rozwoju, na podstawie informacji pozyskanych w związku z prowadzonym przez Komisję Europejską postępowaniem w sprawie niezgodności z prawem pomocy państwa na rzecz polskiego producenta podstawowych organicznych związków chemicznych, tj. Skarżącej, wszczął z urzędu postępowanie w sprawie unieważnienia ww. zezwolenia. Analiza dokumentacji, zgromadzonej przez organ, związanej z udzieleniem przedsiębiorcy zezwolenia, w celu przygotowania odpowiedzi na pytania Komisji Europejskiej wykazała, że powyższe zezwolenie zostało wydane na inwestycję już rozpoczętą, która nie mogła być objęta pomocą regionalną. W związku z tym, że na projekt inwestycyjny polegający na budowie innowacyjnej instalacji do produkcji [...] "[...]" przedsiębiorca uzyskał także wsparcie w ramach poddziałania 4 5.1 POIG, w toku wszczętego postępowania w sprawie unieważnienia zezwolenia nr [...] rozszerzono materiał dowodowy o dokumentację dotyczącą rozpoczęcia realizacji tego projektu. Z dokumentów tych wynika, że już we wrześniu 2012 r. Spółka złożyła zamówienie na urządzenia związane z powyższą inwestycją, a w październiku 2012 r., nastąpiła pierwsza płatność na kwotę 23 854.19 zł.