Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący Sędzia NSA Gabriela Jyż (spr.) Sędzia NSA Krystyna Anna Stec Sędzia del. WSA Izabella Janson po rozpoznaniu w dniu 23 marca 2021 r. na posiedzeniu niejawnym w Izbie Gospodarczej skargi kasacyjnej Ministra Przedsiębiorczości i Technologii od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Warszawie z dnia 5 czerwca 2019 r., sygn. akt VI SA/Wa 480/19 w sprawie ze skargi A. I. S. (K.) Sp. z o.o. w K. na decyzję Ministra Przedsiębiorczości i Technologii z dnia [...] października 2018 r., nr [...] w przedmiocie w przedmiocie zmiany zezwolenia na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie specjalne strefy ekonomicznej 1. oddala skargę kasacyjną; 2. zasądza od Ministra Przedsiębiorczości i Technologii na rzecz A. I. S. (K.) Sp. z o.o. w K. 240 (dwieście czterdzieści) złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania kasacyjnego.
Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie, wyrokiem z dnia 5 czerwca 2019 r., w sprawie ze skargi A. I. S. (K.) Sp. z o.o. w K. na decyzję Ministra Przedsiębiorczości i Technologii z dnia [...] października 2018 r. w przedmiocie zmiany zezwolenia na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie specjalne strefy ekonomicznej, uchylił zaskarżoną decyzję oraz poprzedzającą ją decyzję Ministra Rozwoju i Finansów z dnia [...] grudnia 2017 r. oraz orzekł o kosztach postępowania sądowego.
Sąd I instancji orzekał w następującym stanie sprawy:
G. P. C. P. sp. z o.o. (obecnie: A. I. S. (K.) Sp. z o.o.) w dniu 21 października 1998 r., uzyskała zezwolenie nr [...] na prowadzenie działalności gospodarczej na terenie W. Specjalnej Strefy Ekonomicznej I.-P.. Zezwolenie zostało udzielone do dnia 28 maja 2017 r.
Pismem z dnia 12 maja 2017 r., (doręczonym organowi w dniu 15 maja 2017 r.) skarżąca Spółka wystąpiła do Ministra Rozwoju i Finansów z wnioskiem o zmianę zezwolenia poprzez nadanie pkt II zezwolenia dotyczącego terminu jego obowiązywania następującego brzmienia: "Zezwolenie wygasa z upływem okresu, o którym mowa w § 1 ust. 3 Rozporządzenia Rady Ministrów z dnia 15 grudnia 2008 r. w sprawie wałbrzyskiej specjalnej strefy ekonomicznej (Dz.U. z 2016 r., poz. 1992, ze zm.)". Spółka argumentowała, że art. 19 ust. 4 ustawy z dnia 20 października 1994 r. o specjalnych strefach ekonomicznych (Dz. U. z 2017 r. poz. 1010, ze zm., dalej: ustawa o s.s.e.), nie wyklucza zmiany zezwolenia we wnioskowanym zakresie, jak również okolicznością uchylenia przepisu o udzielaniu zezwoleń na czas określony. Strona podkreślił również, że wnioskowane wydłużenie terminu zezwolenia nie spowoduje zwiększenia pomocy publicznej, a jedynie umożliwi wykorzystanie już przyznanej wysokości pomocy.
Organ w związku z wnioskiem zwrócił się do Zarządzającego Strefą o opinię w sprawie wnioskowanej zmiany zezwolenia nr [...]. W odpowiedzi Zarządzający Strefą, opinią nr [...], pozytywnie ustosunkował się do wnioskowanej zmiany zezwolenia.
Minister Rozwoju i Finansów, decyzją z dnia [...] grudnia 2017 r., odmówił zmiany powołanego zezwolenia.
W wyniku rozpatrzenia wniosku o ponowne rozpoznanie sprawy Minister Przedsiębiorczości i Technologii, decyzją z dnia [...] października 2018 r., utrzymał w mocy rozstrzygnięcie z dnia [...] grudnia 2017 r. Organ w pierwszej kolejności stwierdził, że wydana przez Zarządzającego Strefą opinia, nie miała mocy wiążącej, nie załatwiała sprawy administracyjnej, nie rozstrzygała o jej istocie, ani też nie kończyła postępowania w danej instancji.
Organ wskazał, że strona uzyskała zezwolenie w dniu 21 października 1998 r., pod rządzami ustawy o s.s.e. w brzmieniu obowiązującym do 31 grudnia 2000 r. Przepis art. 16 ust. 9 ustawy o s.s.e. wówczas obowiązujący stanowił, że zezwolenia udziela się na czas oznaczony. Wobec tego zezwolenia nr 15 obwarowane było terminem obowiązywania do dnia 28 maja 2017 r. Zasady udzielania pomocy publicznej przedsiębiorcom, którzy otrzymali zezwolenie do końca 2000 r. były przedmiotem negocjacji akcesyjnych i zostały określone w Traktacie o przystąpieniu do Unii Europejskiej. Konsekwencją negocjacji było ustalenie, iż duzi przedsiębiorcy będą mogli kontynuować korzystanie ze zwolnienia podatkowego, ale z uwagi na niezgodność zasad udzielania pomocy tej grupie przedsiębiorców z regułami unijnymi wprowadzono regulacje znacznie ograniczające wielkość dopuszczalnego wsparcia, co znalazło odzwierciedlenie m.in. w przepisie art. 5 ust. 2 pkt 1 lit. b) ustawy z 2003 r. o zmianie ustawy o s.s.e., który stanowi, że maksymalna dopuszczalna wielkość pomocy publicznej dla przedsiębiorców, którzy uzyskali zezwolenie do końca 1999 r. wynosi 75% kosztów inwestycji poniesionych do dnia 31 grudnia 2006 r. Oznaczało to, że w przedmiotowym przypadku wielkość pomocy została zdefiniowana dla tego projektu i stanowiła nieprzekraczalny poziom możliwy do wykorzystania w okresie obowiązywania zezwolenia - do dnia 28 maja 2017 r. W ocenie organu decyzja zmieniająca zezwolenia nr [...] we wnioskowanym zakresie skutkowałaby wydłużeniem terminu ważności zezwolenia, a w efekcie zwiększeniem pomocy publicznej.