W stanie prawnym obowiązującym w 2004 r., określony w art. 77 par. 3 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997r. Ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./, termin do wydania nowej decyzji, w przypadku uchylenia lub stwierdzenia nieważności jednej z decyzji wskazanych w art. 77 par. 1 pkt 1 lit. "a-d" Ordynacji podatkowej należało liczyć od dnia doręczenia organowi prawomocnego orzeczenia sądu administracyjnego wraz z jego uzasadnieniem i aktami sprawy.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu na rozprawie w Izbie Finansowej skargi kasacyjnej Wojciecha T. od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Rzeszowie z dnia 16 czerwca 2005 r. I SA/Rz 56/05 w sprawie ze skargi Wojciecha T. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w Rz. z dnia 20 grudnia 2004 r. (...) w przedmiocie odmowy zwrotu oprocentowania - oddala skargę kasacyjną; (...).
Zaskarżonym do Sądu odwoławczego wyrokiem z dnia 16 czerwca 2005 r., I SA/Rz 56/05, Wojewódzki Sąd Administracyjny w Rzeszowie oddalił skargę Wojciecha T. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w Rz. z dnia 20 grudnia 2004 r., w przedmiocie odmowy zwrotu oprocentowania.
W motywach ww. orzeczenia Sąd wyjaśnił, że decyzją z dnia 16 maja 2002r. Urząd Skarbowy w M. ustalił podatnikowi wysokość w podatku od spadków i darowizn. Decyzja ta została utrzymana w mocy przez Dyrektora Izby Skarbowej w Rz. Na skutek skargi podatnika Wojewódzki Sąd Administracyjny w Rzeszowie uchylił decyzję organu II instancji, który decyzją z dnia 2 sierpnia 2004 r. uchylił decyzję organu I instancji i ponownie ustalił zobowiązanie podatkowe w podatku od spadków i darowizn w innej kwocie.
Pismem z dnia 11 sierpnia 2004r, Wojciech T. wniósł o zwrot kwoty stanowiącej różnicę pomiędzy wysokością zobowiązania podatkowego, wynikającego z uchylonej decyzji Urzędu Skarbowego w M., a kwotą zobowiązania ustaloną w decyzji Dyrektora Izby Skarbowej w Rz. z dnia 2 sierpnia 2004 r. oraz o zwrot odsetek od kwoty stanowiącej zobowiązanie w podatku od spadków i darowizn, za okres od zapłaty błędnie naliczonego zobowiązania podatkowego tj. od dnia 29 maja 2002 r. do dnia zwrotu tych odsetek.
Nadpłata w podatku od spadków i darowizn została podatnikowi zwrócona wraz z oprocentowaniem na rachunek bankowy. Natomiast decyzją z dnia 15 września 2004 r. Naczelnik Urzędu Skarbowego w M. odmówił zwrotu oprocentowania od kwoty stanowiącej zobowiązanie w podatku od spadków i darowizn. Organ I instancji uznał, że skoro nowa decyzja w przedmiocie ustalenia wysokości zobowiązania podatkowego została wydana w terminie 3 miesięcy od dnia doręczenia organowi podatkowemu orzeczenia sądu administracyjnego wraz z uzasadnieniem /4 czerwca 2004 r./, to w świetle art. 77 par. 3 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997r. Ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./, nadpłatą podlegającą zwrotowi wraz z oprocentowaniem jest jedynie różnica pomiędzy kwotą zapłaconą nienależnie, a kwotą podatku wynikającą z decyzji.
Stanowisko powyższe podtrzymał w spornym akcie prawnym organ odwoławczy. Odnosząc się do zarzutów odwołania wskazał, że powołana w nim data 30 kwietnia 2004 r. dotyczy doręczenia orzeczenia nieprawomocnego, które nie podlegało wykonaniu do chwili jego uprawomocnienia. Ponadto Dyrektor Izby Skarbowej w Rz. wskazał na art. 286 ustawy z dnia 30 sierpnia 2002 r. Prawo o postępowaniu przed sądami administracyjnymi /Dz.U. nr 153 poz. 1270 ze zm./, zgodnie z którym termin do załatwienia sprawy przez organ administracji określony w przepisach prawa lub wyznaczony przez sąd liczy się od dnia doręczenia akt organowi. Te zaś wraz z załączonym odpisem orzeczenia ze stwierdzeniem jego prawomocności zwraca się po uprawomocnieniu się orzeczenia sądu I instancji, co nastąpiło w dniu 4 czerwca 2004 r.