Wojewódzki Sąd Administracyjny w Szczecinie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Ewa Wojtysiak, Sędziowie Sędzia WSA Jolanta Kwiecińska (spr.), Sędzia WSA Anna Sokołowska, Protokolant starszy sekretarz sądowy Beata Radomska, po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 25 stycznia 2017 r. sprawy ze skargi C. Spółki z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w S. na interpretację indywidualną Dyrektora Izby Skarbowej działającego z upoważnienia Ministra Finansów z dnia 26 sierpnia 2016 r. nr [...] w przedmiocie zastosowania przepisów prawa podatkowego 1. uchyla zaskarżoną interpretację indywidualną, 2. zasądza od Dyrektora Izby Skarbowej działającego z upoważnienia Ministra Finansów na rzecz strony skarżącej C. Spółki z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w S. kwotę [...] złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania sądowego.
C. Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością z siedzibą w S. (dalej: bądź "Strona" bądź "Skarżąca") wnioskiem z dnia
30 czerwca 2016 r., wystąpiła do Ministra Finansów o wydanie pisemnej interpretacji przepisów prawa podatkowego dotyczącej podatku dochodowego od osób prawnych w zakresie sposobu prowadzenia ewidencji rachunkowej dla potrzeb prowadzonej działalności gospodarczej na terenie specjalnej strefy ekonomicznej na podstawie kilku zezwoleń.
W złożonym wniosku przedstawiono następujący stan faktyczny i zdarzenie przyszłe.
Strona jest spółką prowadzącą działalność gospodarczą za pośrednictwem wyodrębnionych organizacyjnie zakładów położonych w S. oraz J.. Ponadto na podstawie zezwoleń z 2009 r. oraz 2014 r. prowadzi i prowadzić będzie działalność gospodarczą na obszarze [...] Strefy [...] (dalej: bądź "Strefa" bądź "S.").
Zakład w S. położony jest na terenie Strefy i prowadzi działalność polegającą na produkcji wyrobów mieszczących się w grupowaniach PKWiU wskazanych w ww. zezwoleniach. Działalność ta korzysta ze zwolnienia z opodatkowania podatkiem dochodowym od osób prawnych w oparciu o wartość wydatków inwestycyjnych kwalifikujących się do objęcia pomocą publiczną poniesionych w ramach inwestycji, na którą udzielone zostało Stronie zezwolenie z 2009 r. W przyszłości Strona zamierza skorzystać ze zwolnienia podatkowego na podstawie zezwolenia z 2014 r. Nie wyklucza również ubiegania się o kolejne zezwolenia na prowadzenie działalności gospodarczej na obszarze Strefy.
Strona prowadzi ponadto działalność, z której osiąga dochody opodatkowane podatkiem od osób prawnych na zasadach ogólnych.
Część wyprodukowanych w Strefie produktów jest i będzie w przyszłości zbywana przez Stronę za pośrednictwem zakładu w J. (dalej: "Oddział"), który pełni i będzie pełnić w przyszłości funkcje handlowe i jest zlokalizowany poza Strefą. Ponadto utworzona została jednostka handlowa (dalej: "Jednostka handlowa") również zlokalizowana poza Strefą, która pełni i będzie pełnić w przyszłości funkcje handlowe. Zarówno Oddział, jak i Jednostka handlowa stanowią działalność pomocniczą (obejmującą obsługę klienta, przyjmowanie i realizację zamówień, wydawanie klientom wytworzonych na terenie Strefy wyrobów, itp.) w stosunku do działalności prowadzonej na obszarze Strefy i na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, dochód uzyskany przez Oddział i Jednostkę handlową korzysta ze zwolnienia. Produkty sprzedawane poprzez własny Oddział i Jednostkę handlową nie tracą przymiotu "produktu strefowego", ponieważ nie dochodzi do zmiany ich klasyfikacji dla celów PKWiU.
W związku z powyższym Strona zadała następujące pytania.
1. Czy prowadzenie na terenie Strefy działalności zwolnionej od podatku dochodowego od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych w oparciu o zezwolenia z 2009 r. i 2014 r. (i ewentualne późniejsze zezwolenia) powoduje powstanie po stronie Strony obowiązku prowadzenia ewidencji rachunkowej zgodnie z art. 9 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych pozwalającej ustalić odrębnie dochód (stratę) z działalności zwolnionej od podatku dochodowego od osób prawnych prowadzonej na podstawie posiadanych zezwoleń z 2009 r. i 2014 r. (i ewentualnych późniejszych zezwoleń) i odrębnie dochód (stratę) z działalności podlegającej opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób prawnych?