W uzasadnieniu odwołania Przedsiębiorstwo "A." wskazało, że obie strony transakcji były podatnikiem podatku od towarów i usług, wobec czego pobranie opłaty skarbowej nie może mieć miejsca z uwagi na treść art. 3 ust. 5 pkt 1 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej.
Izba Skarbowa w L. decyzją z dnia 10 lutego 1998 r. utrzymała w mocy zaskarżoną decyzję organu I instancji.
Organ odwoławczy w uzasadnieniu decyzji wskazał, że zwolnienie od opłaty skarbowej określone w art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej ma charakter przedmiotowo-podmiotowy. Nie można zgodzić się z poglądem Spółki W.-L., że przepis ten zawiera generalne zwolnienie od opłaty skarbowej wymienionych w nim czynności cywilnoprawnych, jeżeli są one zawierane pomiędzy podatnikami VAT, bez względu na to co stanowi przedmiot umowy. W sytuacji gdy przedmiot czynności cywilnoprawnej nie jest objęty zakresem ustawy o podatku VAT nie można uznać, że stronami w odniesieniu do tej konkretnej czynności są podatnicy podatku VAT.
Według oceny Izby Skarbowej zawarta między stronami umowa kupna-sprzedaży nie jest świadczeniem usługi finansowej zwolnionej od podatku VAT na podstawie art. 7 ust. 1 pkt 2 ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym. W załączniku nr 2 do tej ustawy w brzmieniu obowiązującym w 1994 r. pod poz. 13 wymienione są usługi w zakresie finansów i ubezpieczeń /symbol KU 94-95/ z wyłączeniami.
W klasyfikacji GUS w gałęzi 94, określonej jako usługi finansowe, wprowadzono podbranżę o symbolu 94101 - usługi bankowe, wśród których wymieniona jest m.in. działalność maklerska w zakresie obrotu papierami wartościowymi, pośrednictwo finansowe. Obrót papierami wartościowymi nie jest ujęty w zakresie działalności Spółki W.-L. Działalności w tym zakresie nie prowadzi także druga strona umowy, to jest Przedsiębiorstwo "A.".
W tej sytuacji do umowy kupna-sprzedaży obligacji zawartej między stronami nie może mieć zastosowania przepis art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej. Nie ma również do niej zastosowania par. 63 pkt 13 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 26 czerwca 1992 r., gdyż odnosi się on do sytuacji, w której nabywca papierów wartościowych prowadzi przedsiębiorstwo maklerskie. "A." przedsiębiorstwa takiego nie prowadzi.
Reasumując - Izba Skarbowa podzieliła w całości stanowisko organu I instancji, że przedmiotowa umowa nie podlega zwolnieniu od opłaty skarbowej. Skargę na decyzję Izby Skarbowej w Lesznie złożyły zarówno W.-L. Spółka z o. o. w W., jak i Przedsiębiorstwo "A." w L.
Spółka W.-L. zarzuciła zaskarżonej decyzji naruszenie przepisów art. 3 ust. 1 pkt 5 lit. "a" ustawy o opłacie skarbowej, art. 2, art. 4, art. 5 i art. 7 ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym i art. 6, art. 7 i art. 8 Kpa i wniosła o uchylenie zaskarżonej decyzji.