Wojewódzki Sąd Administracyjny w Lublinie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Halina Chitrosz, WSA Wiesława Achrymowicz,, WSA Małgorzata Fita (sprawozdawca), Protokolant Referent Paulina Nagajek, po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 23 października 2013 r. sprawy ze skargi P. - B. L. Spółka Akcyjna na interpretację indywidualną Ministra Finansów z dnia [...] nr [...] w przedmiocie podatku dochodowego od osób prawnych. I. uchyla zaskarżoną interpretację; II. zasądza od Ministra Finansów na rzecz P. - B. L. Spółki Akcyjnej kwotę [...] złotych tytułem zwrotu kosztów postępowania.
Interpretacją indywidualną z dnia [...]., wydaną na podstawie art. 14b § 1 i § 6 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. Ordynacja podatkowa (Dz.U. z 2012 r., poz. 749 ze zm., dalej - O.p.), Minister Finansów (dalej - organ podatkowy) stwierdził, że stanowisko Spółki Akcyjnej P. - B. L. (dalej - skarżąca, strona, spółka) przedstawione we wniosku z dnia 24 grudnia 2012 r., uzupełnionym pismami z dnia 8 lutego oraz 2 kwietnia 2013 r., o udzielenie pisemnej interpretacji przepisów prawa podatkowego dotyczącej podatku dochodowego od osób prawnych w zakresie zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów niezamortyzowanej części nakładów na inwestycję w obcym środku trwałym w momencie sprzedaży nieruchomości, jest nieprawidłowe.
W uzasadnieniu organ podatkowy podał, że strona złożyła wniosek o udzielenie pisemnej interpretacji przepisów prawa podatkowego w indywidualnej sprawie dotyczącej podatku dochodowego od osób prawnych w zakresie zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów niezamortyzowanej części nakładów na inwestycję w obcym środku trwałym w momencie sprzedaży nieruchomości.
Z uwagi na braki wniosku, organ podatkowy dwukrotnie wzywał spółkę do jego uzupełnienia pod rygorem pozostawienia wniosku bez rozpatrzenia. W odpowiedzi na wezwania, dniu 11 lutego i 3 kwietnia 2013 r. wpłynęły pisma dotyczące uzupełnienia wniosku.
We wniosku został przedstawiony następujący stan faktyczny.
Spółka jest jednym z największych regionalnych producentów piwa w Polsce wchodzącym w skład grupy kapitałowej P. Na podstawie umowy z dnia 16 października 2006 r. (dalej - umowa najmu) wynajmowała od P. P. spółka z ograniczoną odpowiedzialnością w upadłości (dalej - P.P.) budowle i budynki znajdujące się przy ul. M. w L. na działkach o nr [...] i nr [...] i ponosiła nakłady na utrzymanie tej nieruchomości - bieżące naprawy oraz nakłady na dostosowanie wynajmowanych budynków i budowli do własnych potrzeb. W 2010 r. spółka dokonała nakładów w budynkach w kwocie 1.970.461,22 zł a w 2011 r. w kwocie 3.870,00 zł. W 2010 r. ponosiła również nakłady na budowle: plac - 273.109,05 zł i droga dojazdowa - 211.823,12 zł. Inwestycja w obcym środku trwałym dotycząca budynków jest przez spółkę amortyzowana stawką 10% rocznie, natomiast budowli 4,5 % rocznie.
W umowie najmu strony wyłączyły możliwość rozliczenia wartości poczynionych przez najemcę inwestycji w chwili zakończenia umowy najmu. Nakłady poniesione przez spółkę nie zostały również zaliczone na poczet czynszu za wynajmowane budynki i budowle. W dniu 29 lipca 2009 r. spółka zawarła przedwstępną umowę kupna prawa użytkowania wieczystego (dalej - umowa) wyżej wymienionych działek, wraz z własnością znajdujących się na nich budynków (magazynów), budowli (m.in. plac, droga dojazdowa i rampa przeładunkowa) i urządzeń stanowiących odrębny przedmiot własności (dalej - nieruchomości). W umowie strony zobowiązały się do zawarcia umowy kupna (dalej - umowa kupna) wyżej wymienionego prawa użytkowania wieczystego i praw własności do dnia 31 grudnia 2012 r. za cenę 7.100.000 zł. Ostatnia rata w wysokości 800.000 zł powinna była zostać zapłacona przez spółkę do dnia 31 grudnia 2012 r., co też zostało zrobione.