Wojewódzki Sąd Administracyjny w Lublinie w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Wiesława Achrymowicz, Sędziowie WSA Małgorzata Fita, NSA Anna Kwiatek (sprawozdawca), Protokolant Asystent sędziego Karolina Orłowska, po rozpoznaniu w Wydziale I na rozprawie w dniu 23 maja 2013 r. sprawy ze skargi A.J. M. P.P.R.-S. Spółki z graniczoną odpowiedzialnością na decyzję Dyrektor Izby Skarbowej z dnia [...] nr [...] w przedmiocie podatku od czynności cywilnoprawnych I. uchyla zaskarżoną decyzję, II. orzeka, że zaskarżona decyzja nie podlega wykonaniu w całości, III. zasądza od Dyrektora Izby Skarbowej na rzecz A.J. M. P.P. R.-S. Spółki z graniczoną odpowiedzialnością kwotę [...] tytułem zwrotu kosztów postępowania.
Zaskarżoną decyzją z dnia [...] Dyrektor Izby Skarbowej, po rozpatrzeniu odwołania A. spółki z o.o., uchylił decyzję Naczelnika Urzędu Skarbowego z dnia [...] określającą zobowiązanie w podatku od czynności cywilnoprawnych i przekazał sprawę do ponownego rozpatrzenia.
Z akt sprawy wynika, że organ I instancji ustalił stan faktyczny na podstawie dokumentów księgowych skarżącej Spółki przekazanych przez Dyrektora Urzędu Kontroli Skarbowej przy piśmie z dnia 17.05.2012 r., treści umowy sprzedaży z dnia 20.12.2007 r., na podstawie której Spółka nabyła od A.J.M. składniki majątkowe jego przedsiębiorstwa oraz złożonej przez Spółkę w dniu 16.04.2012 r. deklaracji podatkowej w sprawie podatku od czynności cywilnoprawnej udokumentowanej umową z dnia 20.12.2007 r.
Zgodnie z treścią tej umowy nazwanej przez jej strony "umową sprzedaży przedsiębiorstwa", wymienia ona w § 2 składniki majątkowe przedsiębiorstwa A.J. M., które nie stanowią przedmiotu sprzedaży (nieruchomości zabudowane, urządzenia stanowiące części składowe gruntu, wyposażenie budynków, środki transportu i środki pieniężne) oraz w § 3 składniki majątkowe podlegające sprzedaży (maszyny, maszyny specjalistyczne, urządzenia, towary handlowe - wg stanu na 1.01.2008 r. oraz wierzytelności przysługujące od dłużników sprzedającego - wg stanu na dzień 1.01.2008 r.). W § 4 umowy postanowiono, że kupująca Spółka przystępuje do długów sprzedającego i zobowiązuje się do ich spłaty do kwoty 1.980.000 zł stanowiącej część ceny sprzedaży określonej w § 7 umowy na kwotę 3.500.000 zł i uwzględniającej część ceny już zapłaconej 1.520.000 zł.
W związku z tym organ I instancji uznał, że podatkowi od czynności cywilnoprawnych podlega sprzedaż wyszczególnionych w umowie składników majątkowych przedsiębiorstwa, jako sprzedaż rzeczy i praw majątkowych, zgodnie z art. 1 ust. 1 pkt 1 lit. a ustawy z dnia 9..09.2000 r. o podatku od czynności cywilnoprawnych (tj. Dz.U.z 2007 r. Nr 68, poz. 450 ze zm. - organ podał: tj. Dz.U. z 2010 r., nr 101, poz. 649 - dalej: "pcc").
Organ wskazał, że podstawę opodatkowania przy umowie sprzedaży - stanowi wartość rynkowa rzeczy lub prawa majątkowego (6 ust. 1 pkt 1 lit.c pcc), bez odliczania długów i ciężarów ( art. 6 ust. 2 pcc). Oznacza to, zdaniem organu, że Spółka nie mogła zmniejszyć podstawy opodatkowania w związku z przystąpieniem do długów sprzedającego na podstawie § 4 umowy. Stąd zmniejszenie w złożonej deklaracji wartości rynkowej rzeczy i praw tj. kwoty 3.500.000 zł o kwotę 1.539.420,62 zł przejętych zobowiązań czyli długów i ciężarów i wykazanie tej wartości w kwocie 1.960.579,38 zł, spowodowało zaniżenie zobowiązania podatkowego obliczonego przez Spółkę według stawki 2% na kwotę 39.212 zł.
Określając podatek w kwocie 70.000 zł organ również zastosował stawkę 2% wskazując na treść art. 7 ust. 3 pkt 1 pcc i na brak wyodrębnienia w umowie wartości rzeczy i praw.