1. W myśl art. 72 par. 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./ za nadpłatę uważa się kwotę nadpłaconego lub nienależnie zapłaconego podatku.
2. Jeżeli nienależnie zapłaconym podatkiem w rozumieniu art. 72 par. 1 pkt 1 Ordynacji podatkowej jest zarówno kwota nienależnego podatku, jak i odsetek zapłaconych czy wpłat zarachowanych przez organ podatkowy jako odsetki od tego nienależnego podatku, to zwrot kwot odsetek podlega również oprocentowaniu w trybie art. 77 Ordynacji podatkowej.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu sprawy ze skargi L. Fabryki Maszyn Rolniczych S.A. w L. na decyzję Izby Skarbowej w L. z dnia 22 listopada 2001 r. (...) w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty - uchyla zaskarżoną decyzję oraz poprzedzającą ją decyzję Trzeciego Urzędu Skarbowego w L. z dnia 9 sierpnia 2001 r. (...); (...).
Decyzją z dnia 22 listopada 2001 r. (...) Izba Skarbowa w L., na podstawie art. 233 par. 1 pkt 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa /Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm./, po rozpatrzeniu odwołania L. Fabryki Maszyn Rolniczych S.A. w L. od decyzji Trzeciego Urzędu Skarbowego w L. z dnia 9 sierpnia 2001 r. (...) odmawiającej stwierdzenia, że kwota w wysokości 42.229 zł pobrana na poczet zaległości podatkowej w podatku dochodowym od osób prawnych za 1996 r. stanowi nadpłatę, od której przysługują odsetki; - utrzymała decyzję organu pierwszej instancji w mocy.
W uzasadnieniu tej decyzji podniesiono, że Inspektor Kontroli Skarbowej wydał w dniu 25 marca 1999 r. decyzję (...), w której określił dla LFMR wysokość zobowiązania podatkowego za 1996 r. Decyzją z dnia 13 lipca 1999 r. Izba Skarbowa w L. utrzymała zaskarżoną decyzję Inspektora w mocy.
Na mocy postanowień z dnia 30 sierpnia 1995 r. (...) i (...) Trzeci Urząd Skarbowy dokonał potrącenia na poczet spornej zaległości, z przysługującego Spółce zwrotu podatku naliczonego VAT w łącznej wysokości 79.631,80 zł. Kwota ta została rozliczona w ten sposób, że 37.403 zł zaliczono na poczet spornej zaległości podatkowej, natomiast 42.229 zł na poczet odsetek od tej zaległości.
Wyrokiem Naczelnego Sądu Administracyjnego z dnia 25 listopada 2000 r. I SA/Lu 887/99 uchylona została decyzja Izby Skarbowej oraz poprzedzająca ją decyzja Inspektora Kontroli Skarbowej, określająca dla L. Fabryki Maszyn Rolniczych zobowiązanie podatkowe w podatku dochodowym od osób prawnych za 1996 r.
Mając na uwadze powyższe rozstrzygnięcie organ I instancji dokonał zwrotu nadpłaty podatku dochodowego za 1996 r. przelewem bankowym z dnia 15 marca 2001 r.
Kwotę przelewu stanowiła:
- nadpłata podatku w wysokości 37.403 zł
- oprocentowanie nadpłaty w wysokości 25.802,10 zł
- odsetki za zwłokę w wysokości 42.229 zł.
W dniu 5 lipca 2001 r. Spółka złożyła wniosek o stwierdzenie nadpłaty i ustalenie, że kwota 42.229 zł pobrana na poczet zaległości podatkowej stanowi nadpłatę, od której przysługują odsetki.
Trzeci Urząd Skarbowy wydał zaskarżoną decyzję, w której odmówił uznania jako nadpłaty - kwoty 42.229 zł, stwierdzając, że przepisy obowiązujące w dniu zwrotu nadpłaty podatku nie przewidywały możliwości oprocentowania odsetek za zwłokę pobranych od zaległości podatkowej.
Organ odwoławczy, rozpatrując odwołanie podzielił stanowisko wyrażone w decyzji organu I instancji.
Bezsporne jest, że Trzeci Urząd Skarbowy pobrał kwotę 42.229 zł na poczet zaległości podatkowej w podatku dochodowym od osób prawnych za 1996 r. W związku z wyrokiem NSA z dnia 15 marca 2000 r. dokonano zwrotu nadpłaty podatku w wysokości 37.403 zł, odsetek za zwłokę 42.229 zł oraz oprocentowania nadpłaty podatku w wysokości 25.802,10 zł. Problem oprocentowania odsetek budzi wiele kontrowersji, jednak zdecydowana większość judykatury jest za zastosowaniem w przedmiocie oprocentowania odsetek poglądu prezentowanego przez organ I instancji. Potwierdza to wyrok Sądu Najwyższego z dnia 14 września 1999 r. III RN 65/99 oraz wyrok Naczelnego Sądu Administracyjnego: z dnia 14 września 1998 r. I SA/Gd 552/97 i z dnia 4 lutego 1997 r. SA/Sz 3155/95. Pogląd powyższy, na gruncie przepisów Ordynacji podatkowej reprezentuje wyrok NSA z dnia 3 lutego 2000 r. I SA/Po 2904/98. NSA w wyroku I SA/Kr 479/99 z dnia 6 października 2000 r. wyraził pogląd, że możliwość wypłaty odsetek od odsetek przewidują przepisy Kodeksu cywilnego, których nie stosuje się do spraw podatkowych.