Do podatku akcyzowego nie mają zastosowania przepisy par. 54 ust. 4 pkt 2 i ust. 9 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 15 grudnia 1997 r. w sprawie wykonania przepisów ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym /Dz.U. nr 156 poz. 1024 ze zm./ /obecnie par. 48 ust. 4 pkt 2 i ust. 6 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 22 marca 2002 r. w sprawie wykonania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym - Dz.U. nr 27 poz. 268 ze zm./.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu sprawy ze skargi Mariusza L. na decyzje Izby Skarbowej w Ł. Ośrodek Zamkowy w S. z dnia 7 czerwca 2000 r. (...) przedmiocie podatku akcyzowego za sierpień 1998 r. - styczeń 1999 r. - uchyla zaskarżoną decyzję; (...).
UZaskarżoną decyzją Izba Skarbowa w Ł. utrzymała w mocy decyzję Inspektora Kontroli Skarbowej z Urzędu Kontroli Skarbowej w Ł. z dnia 23 lutego 2000 r. określającą Mariuszowi L. wysokość zobowiązania i zaległości w podatku akcyzowym za miesiące od sierpnia 1998 r. do stycznia 1999 r. wraz z odsetkami za zwłokę. W uzasadnieniu podano, że podatnik prowadził działalność w zakresie wyrobu wyrobów winiarskich podlegającą opodatkowaniu podatkiem akcyzowym. Inspektor zakwestionował prawo do odliczenia podatku akcyzowego z faktur dokumentujących zakup za poszczególne miesiące 1998 r. Jak wynika z par. 9 ust. 8 pkt 1 i 2 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 5 stycznia 1998 r. w sprawie podatku akcyzowego, podatnicy, którzy przed sprzedażą wyrobów winiarskich dokonują ich rozlewu, poddają je leżakowaniu, kupażowaniu, dosładzaniu, doprawianiu nalewka ziołową, nasycaniu dwutlenkiem węgla, podbarwianiu karmelem, doalkoholizowaniu lub maderyzacji, mogą obniżyć podatek akcyzowy należny od sprzedaży tych wyrobów o podatek akcyzowy od wyrobów winiarskich zużytych do ich wytworzenia, zawarty w cenach zakupu lub zapłacony od ich importu. Przepisy rozporządzenia z dnia 16 grudnia 1998 r. w sprawie podatku akcyzowego nałożyły na podatnika obowiązek potwierdzenia faktury w dacie jej wystawienia przez właściwy urząd skarbowy, że sprzedawca nie zalega z płatnością podatku od towarów i usług oraz podatku akcyzowego.
Prawo do odliczenia podatku akcyzowego było uzależnione zatem od spełnienia powyższego warunku. Warunek ten został przez podatnika spełniony. Faktury dokumentujące sprzedaż wyrobów akcyzowych na rzecz PPHU "L.-P." /pod tą nazwą Mariusz L. prowadził działalność gospodarczą/ wystawione przez kontrahentów za poszczególne miesiące 1999 r. zgodnie z par. 12 ust. 10 cyt. rozporządzenia zostały potwierdzone przez właściwy urząd skarbowy, że sprzedawca nie zalega z płatnością podatków VAT i akcyzowego. Natomiast faktury wystawione w 1998 r. nie zostały potwierdzone przez urząd skarbowy. Z zapisu par. 54 ust. 4 pkt 2 rozporządzenia z dnia 15 grudnia 1997 r. w sprawie wykonania przepisów ustawy o podatku od towarów i usług oraz o podatku akcyzowym wynika, że w przypadku, gdy nabywca posiada fakturę lub fakturę korygującą niepotwierdzoną kopią u sprzedawcy, faktury te nie stanowią podstawy do obniżenia podatku należnego oraz zwrotu różnicy podatku lub zwrotu podatku naliczonego. Czynności kontrolne pozwoliły stwierdzić, że kontrahenci "L.-P." z wyjątkiem firmy "A." w dacie czynności nie działali już pod wskazanym adresem, co w konsekwencji uniemożliwiło dostęp do dokumentów podatkowych tych firm i dokonanie sprawdzenia kopii faktur wystawionych dla "L.-P." oraz czy wystawione faktury zostały ujęte w deklaracji dla podatku VAT i podatku akcyzowego. Z par. 54 ust. 9 ww. rozporządzenia wynika, że ust. 4 pkt 2 nie stosuje się w przypadku, gdy wystawca faktury uwzględnił wykazaną w niej sprzedaż i podatek należny w deklaracji dla podatku od towarów i usług.