Nie można przyjąć, że wprowadzenie zmiany stawek podatku od nieruchomości jak również wprowadzenie lub ograniczenie zwolnień od podatków w trakcie roku podatkowego jest niedopuszczalne. Taka zmiana wysokości stawek przewidzianych na dany rok podatkowy może być dokonana przez radę gminy wyłącznie w granicach stawek określonych w ustawie z dnia 12 stycznia 1991 r. o podatkach i opłatach lokalnych /Dz.U. nr 9 poz. 31 ze zm./, a stawki te mogą obowiązywać dopiero od daty wejścia w życie uchwały zmieniającej stawki.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu sprawy ze skargi Elektrowni B. w R. na decyzję Samorządowego Kolegium Odwoławczego w P.-T. z dnia 24 marca 1999 r. (...) w przedmiocie nadpłaty podatku od nieruchomości za 1995 r. - oddala skargę.
W piśmie z dnia 27 listopada 1997 r. Elektrownia B. z siedzibą w R. zwróciła się do Urzędu Gminy w K. o zwrot nadpłaty podatku od nieruchomości za 1995 r. w kwocie 1.011.248,50 zł wraz z odsetkami podnosząc, że nie jest dopuszczalna zmiana stawek podatku od nieruchomości w ciągu roku podatkowego.
Decyzją z dnia 30 grudnia 1997 r. Wójt Gminy K. odmówił dokonania zwrotu na rzecz podatnika powyższej kwoty wraz z odsetkami.
Samorządowe Kolegium Odwoławcze w P.-T. po rozpatrzeniu odwołania podatnika decyzją z dnia 22 października 1998 r. uchyliło rozstrzygnięcie organu I instancji i przekazało mu sprawę do ponownego rozpatrzenia.
Decyzją z dnia 8 grudnia 1998 r. Wójt Gminy K. stwierdził istnienie nadpłaty w podatku od nieruchomości za miesiąc luty 1995 r. w kwocie 92.085,93 zł i dokonał zwrotu tej kwoty na konto podatnika oraz odmówił stwierdzenia istnienia nadpłaty za miesiące marzec-grudzień 1995 r. w wysokości 919.162,57 zł odmawiając zwrotu tej kwoty na konto podatnika.
Samorządowe Kolegium Odwoławcze w P.-T. po rozpatrzeniu odwołania podatnika od tej decyzji, decyzją z dnia 24 marca 1999 r. utrzymało w mocy rozstrzygnięcie organu I instancji.
W uzasadnieniu decyzji wskazano, że jedyną kwestią sporną jest to, czy możliwe było zastosowanie stawek podatku od nieruchomości za rok 1995 za miesiące marzec-grudzień tego roku a uchwalonych przez Radę Gminy w lutym 1995 r. Uchwała (...) Rady Gminy K. z dnia 6 lutego 1995 r. w sprawie ustalenia stawek podatku od nieruchomości zawiera postanowienie, że wchodzi w życie z dniem podjęcia. Organ odwoławczy rozpatrując odwołanie Elektrowni B. od decyzji Wójta Gminy K. z dnia 30 grudnia 1997 r. powziął wątpliwości, czy uchwała Rady Gminy K. podjęta w dniu 6 lutego 1995 r. mogła mieć zastosowanie do obliczenia podatku należnego za rok 1995 i wystąpił z pytaniem prawnym do Naczelnego Sądu Administracyjnego w Warszawie.
Naczelny Sąd Administracyjny w uchwale z dnia 31 sierpnia 1998 r. FPK 3/98 odmówił udzielenia odpowiedzi na pytanie prawne, ale w uzasadnieniu uchwały wywiódł, że w stosunku do uchwały Rady Gminy w K. z dnia 6 lutego 1995 r. istnieje domniemanie zgodności z prawem a Samorządowe Kolegium Odwoławcze jest nią związane i nie może jej pominąć przy rozpatrywaniu sprawy. Stawki podatku od nieruchomości zapłacone przez Elektrownię B. w za okres od lutego do grudnia 1995 r. zawarte w uchwale (...) Rady Gminy w K. z dnia 6 lutego 1995 r. były stawkami obowiązującymi dla podatników jak i organów podatkowych. Zapłata przez stronę podatku od nieruchomości za okres od marca do grudnia 1995 r. według stawek przewidzianych w tej uchwale nie oznacza, że nastąpiła nadpłata podatku w rozumieniu przepisów art. 72 par. 1 ustawy Ordynacja podatkowa.