Wojewódzki Sąd Administracyjny w Kielcach w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Artur Adamiec (spr.), Sędziowie Sędzia WSA Maria Grabowska, Sędzia WSA Danuta Kuchta, Protokolant Starszy inspektor sądowy Anna Szyszka, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 13 września 2018 r. sprawy ze skargi M. R. Sp. z o.o. Przedsiębiorstwo Gospodarki Odpadami Sp. komandytowa w K. na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w K. z dnia [...] r. nr [...] w przedmiocie podatku od czynności cywilnoprawnych oddala skargę.
1.Decyzja organu administracji publicznej i przedstawiony przez organ tok postępowania.
1.1. Dyrektor Izby Administracji Skarbowej w K. decyzją z [...], nr [...]utrzymał w mocy decyzję Naczelnika Drugiego Urzędu Skarbowego w K. nr [...] z [...] w sprawie określenia wysokości zobowiązania podatkowego w podatku od czynności cywilnoprawnych z tytułu umowy sprzedaży zabudowanej nieruchomości o pow. 13 212 m2 składającej się z działki nr 1578/349 położonej w miejscowości P. gm. P., zgodnie z aktem notarialnym z 24 sierpnia 2012 r. Repertorium A nr 541/2012 w kwocie 40 540 zł.
1.2. Organ podał, że w dniu 24.08.2012r. przed Notariuszem A.K., aktem notarialnym Repertorium A Nr 541/2012 została zawarta umowa sprzedaży w.w. nieruchomości gruntowej zabudowanej stacją demontażu pojazdów, objętej księgą wieczystą nr KIIL/00075386/2 pomiędzy M. C. reprezentującym Przedsiębiorstwo Gospodarki Odpadami M. Recycling Sp. z o.o.
w K. jako kupującym a małżonkami E.i I. C. jako sprzedającymi. Cenę transakcji strony umowy określiły na kwotę 690 000 zł. Notariusz jako płatnik z tytułu zawarcia w/w umowy sprzedaży zabudowanej nieruchomości pobrał podatek od czynności cywilnoprawnych wg stawki 2% w kwocie 13 800 zł. Przedsiębiorstwo Gospodarki Odpadami M.Recycling S. z o.o. z siedzibą w K. przekształciło się w M. Recycling Sp. z o.o. Przedsiębiorstwo Gospodarki Odpadami Sp. k. z siedzibą w K..
1.3. Naczelnik Drugiego Urzędu Skarbowego w K. w ramach czynności sprawdzających wezwał M.Recycling Sp. z o.o. Przedsiębiorstwo Gospodarki Odpadami Sp. k. do złożenia na przesłanym druku opisu nieruchomości nabytej na podstawie w/w aktu notarialnego. Opis wpłynął do Urzędu Skarbowego w dniu 15.03.2017 r., zaś jego korekty w dniach: 3.04.2017 r. oraz 18.04.2018 r. Naczelnik Drugiego Urzędu Skarbowego w K. wszczął z urzędu postępowanie podatkowe w sprawie określenia wysokości zobowiązania podatkowego w podatku od czynności cywilnoprawnych. Wartość określona przez strony według oceny organu podatkowego nie odpowiadała wartości rynkowej w rozumieniu art. 6 ust. 1 ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych. Organ podatkowy wezwał spółkę do podwyższenia wartości nabytej nieruchomości do kwoty 1 783 123 zł. Poinformowała ona, że nie wyraża zgody na zmianę wartości przedmiotu czynności cywilnoprawnej. W jej ocenie, ustalona w umowie sprzedaży cena nieruchomości odpowiada wartości rynkowej zdefiniowanej w art. 6 ust. 2 ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych.
1.4. Rzeczoznawca majątkowy W. D. dokonał wyceny wartości rynkowej przedmiotowej nieruchomości na kwotę 2 027 000 zł (operat szacunkowy z dnia 4.10.2017 r.). W oparciu o wycenę Naczelnik Drugiego Urzędu Skarbowego w K. określił spółce zobowiązanie podatkowe w podatku od czynności cywilnoprawnych.