Wojewódzki Sąd Administracyjny w Gliwicach w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia NSA Eugeniusz Christ, Sędziowie WSA Beata Kozicka, Bożena Pindel (spr.), Protokolant Karolina Czaplicka, po rozpoznaniu na rozprawie w dniu 30 października 2012 r. sprawy ze skargi A S.A. w T. na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w K. z dnia [...] nr [...] w przedmiocie podatku dochodowego od osób prawnych oddala skargę.
Skarżąca A Spółka Akcyjna z siedzibą w T. wniosła skargę na decyzję Dyrektora Izby Skarbowej w K, z dnia [...] r. nr [...], utrzymującą w mocy decyzję Naczelnika Urzędu Skarbowego w T. z dnia [...] r. nr [...] określającą zobowiązanie z tytułu podatku dochodowego od osób prawnych za 2009 r. w wysokości [...] zł oraz nadpłatę w podatku dochodowym od osób prawnych w wysokości [...] zł.
Decyzję wydano na tle następującego stanu faktycznego.
W dniu 11 września 2008 r. spółka A SA zawarła z B sp. z o.o. z siedzibą w J. umowę o generalne wykonawstwo budowy fabryki estrów metylowych olejów roślinnych, która zlokalizowana jest na terenie [...] Specjalnej Strefy Ekonomicznej. Z punktu 19 wymienionej umowy wynika zastrzeżenie, że jeżeli wykonawca wykona przedmiot umowy w sposób wadliwy lub istotnie sprzeczny z umową, inwestor (A SA) może wezwać go do zmiany sposobu wykonania i wyznaczyć mu w tym celu odpowiedni termin nie krótszy niż 14 dni, a po bezskutecznym upływie wyznaczonego terminu inwestor może od umowy odstąpić. W razie odstąpienia od umowy z przyczyn, o których mowa wyżej, wykonawca jest zobowiązany w terminie 7 dni od pisemnego powiadomienia go o odstąpieniu, do zapłaty kary umownej w wysokości [...] zł (tj. 10% wynagrodzenia netto określonego w umowie). Na podstawie wskazanych zapisów umowy A SA, w związku z wykonaniem przedmiotu umowy w sposób wadliwy oraz istotnie sprzeczny z jej postanowieniami, ostatecznie wystosowała do wykonawcy oświadczenie o odstąpieniu od umowy. Ponieważ B sp. z o.o. kwestionowała zasadność odstąpienia od umowy przez spółkę A SA, a także obowiązek zapłaty kary umownej, wyegzekwowanie kary umownej nastąpiło w drodze jednostronnego oświadczenia spółki o potrąceniu znacznej części powyższej kwoty tj. kwoty [...] zł z kwotą wierzytelności B sp. z o.o. wynikającej z faktury VAT nr [...] z dnia 8 czerwca 2009 r. wystawionej przez kontrahenta na rzecz spółki A SA, z tytułu wynagrodzenia za wcześniej wykonane usługi budowy fabryki (potrącenie nastąpiło w trybie art. 499 k.c.).
Dodatkowym zabezpieczeniem należytego wykonania umowy z dnia 11 września 2008 r. o generalne wykonawstwo budowy fabryki było ustanowienie na rzecz A SA gwarancji ubezpieczeniowej przez C SA. W związku z odstąpieniem od umowy spółka w dniu 16 czerwca 2009 r. wystąpiła do ubezpieczyciela z żądaniem zapłaty z tytułu udzielonej gwarancji należytego wykonania umowy. Kwota gwarancji w wysokości [...] zł przekazana została w dniu 3 sierpnia 2009 r. na rachunek bankowy wnioskodawcy na pokrycie roszczeń powstałych w związku z niewykonaniem umowy przez kontrahenta. Otrzymana przez spółkę gwarancja dotycząca zobowiązań kontrahenta z tytułu nienależytego wykonania umowy do dnia 31 grudnia 2009 r. nie została ostatecznie rozliczona ze względu na trwający pomiędzy spółką, a kontrahentem spór sądowy na gruncie wykonania umowy.
Spółka A SA złożyła w dniu 30 marca 2010 r. w Urzędzie Skarbowym w T. zeznanie CIT-8 o wysokości osiągniętego dochodu (poniesionej straty) przez podatnika podatku dochodowego od osób prawnych za rok 2009. Następnie w dniu 20 kwietnia 2010 r. złożyła pierwszą korektę wymienionego zeznania, zaś w dniu 23 czerwca 2010 r. do organu pierwszej instancji wpłynęła kolejna korekta wraz z wnioskiem o stwierdzenie nadpłaty w podatku dochodowym od osób prawnych w kwocie [...] zł, która miała wynikać z nieopodatkowania podatkiem dochodowym otrzymanej przez spółkę w roku 2009 kwoty kary umownej i kwoty gwarancji.