W przypadku podatku obrotowego w sytuacji kiedy w drodze szacunku zostaje ustalona jedynie część podstawy opodatkowania w sposób precyzyjny można wyliczyć część należnego z tego tytułu podatku obrotowego, a w konsekwencji tylko tę część podatku będzie można określić mianem spornej kwoty podatku w rozumieniu par. 1 ust. 2 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 20 września 1982 r. w sprawie zakresu działania, składu osobowego, trybu powoływania oraz organizacji podatkowych komisji odwoławczych /Dz.U. nr 30 poz. 212 ze zm./, która pozostaje w związku z szacunkowym ustaleniem podstawy opodatkowania.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu sprawy ze skargi Romana N. na decyzję Izby Skarbowej w T. w przedmiocie podatku obrotowego za 1993 r. - oddala skargę.
Pierwszy Urząd Skarbowy w T. decyzją z dnia 7 grudnia 1995 r. (...) określił należny od Romana N. podatek obrotowy za 1993 r. z tytułu prowadzonej przez niego działalności gospodarczej w ramach własnej firmy (...) w T. na łączną kwotę 261.993,90 zł /po denominacji/ tj. w kwocie 158.372,96 zł /po denominacji/ wyższej niż wykazana w deklaracjach podatkowych. Określając należny podatek obrotowy w kwocie wyższej od zadeklarowanej Urząd Skarbowy zakwestionował jedynie podatek od działalności wytwórczej związanej z produkcją przez podatnika napojów gazowanych, zaś od pozostałej prowadzonej przez podatnika innej działalności gospodarczej przyjął podatek w wysokości wykazanej w deklaracjach podatkowych.
W toku prowadzonego postępowania podatkowego Urząd Skarbowy ustalił, iż podatnik od 1 stycznia 1993 r. rozpoczął produkcję wód gazowanych w pomieszczeniach dzierżawionych od Wiktora S. prowadzącego działalność w ramach własnej firmy P.P.H. H.P. "W."(...).
Na podstawie umowy z dnia 1 lutego 1993 r. firma "W." Wiktora S. przyjęła obowiązki generalnego dystrybutora napojów produkowanych przez podatnika.
W okresie od stycznia 1993 r. do 30 kwietnia 1993 r. napoje gazowane wyprodukowane przez firmę (...) były sprzedawane wyłącznie w butelkach dla różnych odbiorców z przeznaczeniem do ich dalszej odsprzedaży przy czym od wartości sprzedaży naliczono 24 procent podatek obrotowy.
W dniu 30 kwietnia 1993 r. między podatnikiem firma (...) a Wiktorem S. firma (...) zostały zawarte dwie umowy obowiązujące od dnia 1 maja do 4 lipca 1993 r., w myśl których podatnik zobowiązał się do sprzedaży firmie "W." napoje gazowane luzem oraz do konfekcjonowania i składowania tychże napojów luzem stanowiących własność Wiktora S.
Roztwór napojów sprzedawanych firmie "W." nie opuszczał zbiorników, w których został wyprodukowany przez podatnika i w tym samym dniu został konfekcjonowany w mniejsze opakowanie będące własnością podatnika lecz już jako towar stanowiący własność Wiktora S.
Organ podatkowy oceniając, iż ww. umowy cywilnoprawne zostały zawarte jedynie w celu zmniejszenia obowiązku podatkowego w zakresie podatku obrotowego uznał, iż nie mogą one wywierać skutków w dziedzinie prawa podatkowego i w konsekwencji całą wartość wyprodukowanych i sprzedanych firmie "W." napojów gazowanych w okresie od 1 maja 1993 r. do 4 lipca 1993 r. opodatkował podatkiem obrotowym według stawki 24 procent.
Jednocześnie organ podatkowy zakwestionował prowadzone przez podatnika księgi podatkowe jako nierzetelne i wadliwe i podstawę opodatkowania w zakresie działalności wytwórczej związanej z produkcją napojów gazowanych opodatkowaną według stawki 24 procent ustalił na podstawie materiałów źródłowych w wysokości 9.009.972.700 zł /przed denominacją/ określając należny z tego tytułu podatek w kwocie 2.162.393.448 zł.