Wojewódzki Sąd Administracyjny w Bydgoszczy w składzie następującym: Przewodniczący Sędzia WSA Halina Adamczewska-Wasilewicz Sędziowie Sędzia WSA Tomasz Wójcik Asesor WSA Joanna Ziołek (spr.) po rozpoznaniu na posiedzeniu niejawnym w dniu 18 października 2022 r. sprawy ze skargi J. L. na decyzję Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Bydgoszczy z dnia 21 lipca 2022 r. nr 0401-IOD2.4104.19.2022 w przedmiocie odmowy stwierdzenia nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych 1. uchyla zaskarżoną decyzję, 2. zasądza od Dyrektora Izby Administracji Skarbowej w Bydgoszczy na rzecz J. L. kwotę 997,00 (dziewięćset dziewięćdziesiąt siedem) zł tytułem zwrotu kosztów postępowania, 3. nakazuje zwrócić ze Skarbu Państwa - Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Bydgoszczy na rzecz J. L. kwotę 1.380 (jeden tysiąc trzysta osiemdziesiąt) zł tytułem nadpłaconego wpisu od skargi.
W dniu [...] r., na podstawie aktu notarialnego Rep. A Nr [...] sporządzonego przez notariusza [...] skarżąca J. L. nabyła od W. G. i K. G. w drodze umowy sprzedaży zabudowaną nieruchomość rolną o [...] ha położoną w miejscowości P., objętą KW nr [...]. Uzgodniona cena przedmiotu sprzedaży wyniosła łącznie kwotę [...]zł, w tym cena za budynki łącznie kwotę [...]zł i cena za nieużytki kwotę [...]zł. Tytułem podatku od czynności cywilnoprawnych na podstawie ustawy z dnia [...] r. o podatku od czynności cywilnoprawnych (t.j. Dz. U. z 2022 r. poz. 111) (dalej: u.p.c.c) notariusz pobrał od strony kupującej zgodnie z art. 7 ust. 1 pkt 1 lit. a i pkt 7 lit. b ww. ustawy kwotę [...]zł.
W dnia [...] r. skarżąca złożyła w Urzędzie Skarbowym w M. wniosek o stwierdzenie nadpłaty w podatku od czynności cywilnoprawnych. W uzasadnieniu wniosku skarżąca wskazała, że dnia [...] r. nabyła od W. G. i K. G. w drodze umowy sprzedaży zabudowaną nieruchomość rolną o pow. [...] ha położoną w miejscowości P., objętą KW nr [...]. Uzgodniona cena przedmiotu sprzedaży wyniosła łącznie kwotę [...]zł, w tym cena za budynki łącznie kwotę [...]zł i cena za nieużytki kwotę [...]zł. Notariusz pobrał od tej transakcji podatek w kwocie [...]zł. Tymczasem zdaniem skarżącej art. 9 pkt 2 ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych (dalej: u.p.c.c.) przewiduje zwolnienie z podatku rolnika w przypadku, gdy w wyniku transakcji powstało lub zostało powiększone gospodarstwo rolne, którego powierzchnia będzie nie mniejsza niż 11 ha i nie większa niż 300 ha. Zwolnienie wskazane w ww. przepisie ustawy stanowi pomoc de minimis w rolnictwie, o której mowa w rozporządzeniu Komisji (UE) nr 1408/2013 z dnia 18 grudnia 2012 r. w sprawie stosowania art. 107 i 108 Traktatu o funkcjonowaniu Unii Europejskiej do pomocy de minimis w sektorze rolnym (Dz. Urz. UE L 352 z 24 grudnia 2013 r.) (dalej: rozporządzenie nr 1408/2013). Na dzień sprzedaży i składania wniosku zwolnienie od podatku od czynności cywilnoprawnych jest objęte pomocą de minimis w rolnictwie do kwoty 20.000 euro w okresie 3 lat na gospodarstwo. Skarżąca oświadczyła, że spełnia wszystkie przesłanki konieczne do zwolnienia z podatku od czynności cywilnoprawnych bowiem nabyła nieruchomość rolną powiększając posiadane przez nią gospodarstwo rolne do ok. [...] ha. Ponadto J. L. złożyła oświadczenie, że gospodarstwo to będzie przez nią prowadzone przez okres co najmniej 5 lat od dnia nabycia. Skarżąca zaznaczyła również, że przeliczenie kwoty [...]euro według kursu średniego NBP z dnia [...] 2022 r., a wynoszącego [...] zł, daje kwotę zwolnienia od podatku od czynności cywilnoprawnych w kwocie [...]zł. J. L. wystąpiła o zwrot tej kwoty na jej rzecz wskazując na to, że jeżeli kwota poniesiona przez skarżącą na podatek od czynności cywilnoprawnych jest wyższa niż kwota zwolnienia przewidzianego w art. 9 ust. 2 u.p.c.c. w związku z przepisami rozporządzenia nr [...] to skarżącej przysługuje zwrot nadpłaty podatku w wysokości ustalonego i niewykorzystanego przez skarżącą limitu pomocy de minimis w rolnictwie.