Naczelny Sąd Administracyjny w składzie: Przewodniczący Sędzia NSA Ludmiła Jajkiewicz (spr.) Sędzia NSA Anna Robotowska Sędzia del. WSA Dariusz Dudra Protokolant Piotr Mikucki po rozpoznaniu w dniu 27 marca 2013 r. na rozprawie w Izbie Gospodarczej skargi kasacyjnej A. Spółki z o.o. w W. od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w W. z dnia 1 kwietnia 2011 r. sygn. akt III SA/Wa 1894/10 w sprawie ze skargi A. Spółki z o.o. w W. na decyzję Dyrektora Izby Celnej w W. z dnia [...] maja 2010 r. nr [...] w przedmiocie stwierdzenia nieważności decyzji ostatecznej oddala skargę kasacyjną.
Wyrokiem z dnia 1 kwietnia 2011 r., sygn. akt III SA/Wa 1894/10, Wojewódzki Sąd Administracyjny w W. oddalił skargę A. Sp. z o.o. z siedzibą w W. na decyzję Dyrektora Izby Celnej w W. z dnia [...] maja 2010 r., nr [...].
Za podstawę rozstrzygnięcia Sąd przyjął następujący stan sprawy:
W dniu 29 sierpnia 2000 r. do Urzędu Skarbowego W. wpłynął wniosek A. Sp. z o.o. wraz z korektami deklaracji AKC-2 i AKC-2/E o stwierdzenie nadpłaty w podatku akcyzowym za poszczególne okresy rozliczeniowe od stycznia do grudnia 1999 r. i zwrot nadpłaty w łącznej kwocie 109 554,00 zł.
Urząd Skarbowy W. decyzją z dnia [...] marca 2001 r., nr [...] odmówił stwierdzenia nadpłaty w podatku akcyzowym za ww. okresy. Decyzja ta została utrzymana w mocy decyzją Izby Skarbowej w W. z dnia 2 lipca 2001 r., nr [...]
W dniu 24 sierpnia 2000 r. do Urzędu Skarbowego W. wpłynął wniosek skarżącej wraz z korektami deklaracji AKC-2 i AKC-2/E o stwierdzenie nadpłaty w podatku akcyzowym za poszczególne okresy rozliczeniowe od stycznia do czerwca 2000 r. i zwrot nadpłaty w łącznej kwocie 109 580,00 zł.
Urząd Skarbowy W. decyzją z dnia [...] marca 2001 r., nr [...] odmówił stwierdzenia nadpłaty w podatku akcyzowym za ww. okres w kwocie 109 580,00 zł. Izba Skarbowa w W. decyzją z dnia 2 lipca 2001 r., nr VC/732-7/2001/MS utrzymała w mocy zaskarżoną decyzję organu podatkowego I instancji.
Pismem z dnia 7 listopada 2005 r. skarżąca wniosła o stwierdzenie nieważności ww. decyzji Izby Skarbowej w W. z dnia [...] lipca 2001 r. Wskazała, że w okresie od stycznia 1999 r. do czerwca 2000 r. omyłkowo odprowadziła podatek akcyzowy z tytułu sprzedaży samochodów osobowych niezarejestrowanych na terytorium Rzeczypospolitej Polskiej.
Decyzją z dnia [...] kwietnia 2006 r. Dyrektor Izby Celnej w W. odmówił stwierdzenia nieważności decyzji Izby Skarbowej w W. z dnia [...] lipca 2001 r. utrzymujących w mocy decyzje Urzędu Skarbowego W. dnia [...] marca 2001 r. Po rozpatrzeniu odwołania Dyrektor Izby Celnej w W. decyzją z dnia [...] listopada 2006 r., utrzymał w mocy zaskarżoną decyzję.
Zarówno ta decyzja, jak i poprzedzająca ją decyzja z dnia [...] kwietnia 2006 r. zostały uchylone przez Wojewódzki Sąd Administracyjny w W. wyrokiem z dnia 20 czerwca 2007 r., sygn. akt III SA/Wa 457/07. W uzasadnieniu wyroku Sąd stwierdził, iż wydając w sprawie ponownie decyzję organ podatkowy jest obowiązany uwzględnić wskazania Sądu co do rozumienia naruszonych przepisów związanych ze skutkiem wywołanym złożeniem przez podatnika korekty deklaracji, a także rozważyć kwestię możliwości wszczęcia postępowania w sprawie stwierdzenia nieważności.
Pismem z dnia 5 września 2007 r. skarżąca rozszerzyła zawarte w pierwotnie złożonym wniosku z dnia 7 listopada 2005 r. żądanie i wniosła dodatkowo o stwierdzenie nieważności decyzji Urzędu Skarbowego W. z dnia [...] marca 2001 r. nr [....] i nr [...] utrzymanych w mocy decyzjami Izby Skarbowej w W. z dnia [...] lipca 2001 r.