Przepis par. 54 ust. 5 pkt 1 rozporządzenia Ministra Finansów z dnia 21 grudnia 1995 r. w sprawie wykonywania niektórych przepisów ustawy o podatku od towarów i usług oraz podatku akcyzowym /Dz.U. 154 poz. 797 ze zm./ przewidywał zakaz prawa do obniżenia podatku należnego oraz zwrotu różnicy podatku lub zwrotu podatku naliczonego z faktury, w której nie zapłacono zakładowi pracy chronionej w formie pieniężnej za pośrednictwem banku. A zatem aby podatnik uzyskał prawo do odliczenia z faktury wystawionej przez zakład pracy chronionej musi nastąpić zapłata za tę fakturę w formie należności pieniężnej i to za pośrednictwem banku.
Naczelny Sąd Administracyjny po rozpoznaniu na rozprawie w I Wydziale Izby Finansowej skargi kasacyjnej Przedsiębiorstwa Usługowo - Handlowego "I." s.c. Krystian Sz., Roman D. z siedzibą w I. od wyroku Wojewódzkiego Sądu Administracyjnego w Gliwicach z dnia 1 marca 2004 r. I SA/Ka 82-84/03 w sprawie ze skargi Przedsiębiorstwa Usługowo - Handlowego "I." s.c. Krystian Sz., Roman D. z siedzibą w I. na decyzje Izby Skarbowej w K. z dnia 20 grudnia 2002 r. (...) w przedmiocie określenia wysokości podatku od towarów i usług - oddala skargę kasacyjną, (...)
Zaskarżonym wyrokiem z dnia 1 marca 2004 r., I SA/Ka 82-84/03 Wojewódzki Sąd Administracyjny w Gliwicach oddalił skargę Spółki Cywilnej "I." P.U.H. w I. na decyzje Izby Skarbowej w K. z dnia 20 grudnia 2002 r. (...) w przedmiocie określenia wysokości podatku od towarów i usług.
Jak wynika z akt sprawy Izba Skarbowa w K. po rozpatrzeniu odwołań Krystiana Sz. i Romana D. wspólników Spółki Cywilnej "I." w I. od decyzji Inspektora Kontroli Skarbowej wydanych w wyniku ponownego rozpatrzenia spraw o numerach:
I. - (...) - określającej zobowiązanie podatkowe i zaległość podatkową w podatku od towarów i usług za miesiąc sierpień 1997 r. w kwotach po 15.107 zł, odsetki za zwłokę na dzień wydania decyzji w kwocie 29.503,60 zł oraz ustalającej dodatkowe zobowiązanie podatkowe w tym podatku w wysokości 14.628 zł,
(...) - określającej zobowiązanie i zaległość podatkową w podatku od towarów i usług za miesiąc grudzień 1997 r. w kwotach po 56.688 zł, odsetki za zwłokę na dzień wydania decyzji w kwocie 100.831,70 zł oraz ustalającej dodatkowe zobowiązanie w tym podatku w wysokości 18.932 zł, decyzją z dnia 20 grudnia 2002 r.
(...) uchyliła decyzje organu pierwszej instancji w części ustalającej kwotę dodatkowego zobowiązania i ustaliła dodatkowe zobowiązanie: za miesiąc sierpień 1997 r. w wysokości 4.532 zł, za miesiąc grudzień 1997 r. w wysokości 17.006 zł oraz utrzymała w mocy w pozostałej części objęte odwołaniem decyzje,
(...) - określającej nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym w podatku od towarów i usług za miesiąc październik 1997 r. do przeniesienia na następny miesiąc w kwocie 3.395 zł,
(...) - określającej nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym w podatku od towarów i usług za miesiąc styczeń 1998 r. do przeniesienia na następny miesiąc w kwocie 826 zł, (...) - określającej nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym w podatku od towarów i usług za miesiąc luty 1998 r. do przeniesienia na następny miesiąc w kwocie 2.389 zł,
(...) - określającej zobowiązanie i zaległość podatkową w podatku od towarów i usług za miesiąc marzec 1998r. w kwotach po 9.354 zł oraz odsetki za zwłokę na dzień wydania decyzji w kwocie 15.378,60 zł,
(...) - określającej zobowiązanie i zaległość podatkową w podatku od towarów i usług za miesiąc kwiecień 1998 r. w kwotach po 87 zł oraz odsetki za zwłokę na dzień wydania decyzji w kwocie 139,50 zł,
(...) - określającej nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym w podatku od towarów i usług za miesiąc maj 1998 r. do przeniesienia na następny miesiąc w kwocie 972 zł,
(...) - określającej nadwyżkę podatku naliczonego nad należnym w podatku od towarów i usług za miesiąc czerwiec 1998 r. do przeniesienia na następny miesiąc w kwocie 4.050 zł,